PDB ID: 6RFR
Hetero Atom Contents
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Select chain: Sequence
Data format:
Color scheme of protein:
Code | Name | Style | Show | Link | |
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3PE | 1,2-diacyl-sn-glycero-3-phosphoethanolamine | PoSSuM | |||
CDL | Cardiolipin | PoSSuM | |||
CPL | 1-palmitoyl-2-linoleoyl-sn-glycero-3-phosphocholine | PoSSuM | |||
FES | Fe2/s2 (inorganic) cluster | PoSSuM | |||
FMN | Flavin mononucleotide | PoSSuM | |||
LMN | Lauryl maltose neopentyl glycol | PoSSuM | |||
NDP | Nadph dihydro-nicotinamide-adenine-dinucleotide phosphate | PoSSuM | |||
PLC | Diundecyl phosphatidyl choline | PoSSuM | |||
SF4 | Iron/sulfur cluster | PoSSuM | |||
T7X | Phosphatidylinositol | PoSSuM | |||
UQ9 | Ubiquinone-9 | PoSSuM | |||
ZMP | S-[2-({N-[(2s)-2-hydroxy-3,3-dimethyl-4-(phosphonooxy)butanoyl]-beta-alanyl}amino)ethyl] tetradecanethioate | PoSSuM | |||
ZN | Zinc ion | PoSSuM |
Code | Name | Show |
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Code | Name | Emphasize |
---|
Code | Name | Show |
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Download interaction data: 6RFR
Structure summary
Code : | 6RFR PDBj RCSB PDB PDBe | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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Header : | OXIDOREDUCTASE | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Title : | Cryo-EM structure of respiratory complex I from Yarrowia lipolytica at 3.2 A resolution | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Release Data : | 2019-12-11 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Compound : |
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Source : |
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Authors : | Parey, K., Vonck, J. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Keywords : | Complex I, NADH dehydrogenase, Mitochondrion Proton pumping, Ubiquinone, OXIDOREDUCTASE | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Exp. method : | ELECTRON MICROSCOPY ( 3.2 Å ) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Citation : |
High-resolution cryo-EM structures of respiratory complex I: Mechanism, assembly, and disease.
Parey, K.,Haapanen, O.,Sharma, V.
et al.
PubMed: 31844670 |
Reaction
Chain : | A |
---|---|
UniProt : | Q9UUU3 (Q9UUU3_YARLL) |
Reaction : | - |
Chain : | B | ||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
UniProt : | Q9UUU2 (Q9UUU2_YARLL) | ||||||||
|
Chain : | C |
---|---|
UniProt : | Q9UUU1 (Q9UUU1_YARLL) |
Reaction : | - |
Chain : | D |
---|---|
UniProt : | A0A1D8NC63 (A0A1D8NC63_YARLL) |
Reaction : | - |
Chain : | E |
---|---|
UniProt : | A0A371BY45 (A0A371BY45_YARLL) |
Reaction : | - |
Chain : | F |
---|---|
UniProt : | A0A371C5F3 (A0A371C5F3_YARLL) |
Reaction : | - |
Chain : | G |
---|---|
UniProt : | Q9UUU0 (Q9UUU0_YARLL) |
Reaction : | - |
Chain : | H |
---|---|
UniProt : | Q9UUT9 (Q9UUT9_YARLL) |
Reaction : | - |
Chain : | I |
---|---|
UniProt : | Q9UUT8 (Q9UUT8_YARLL) |
Reaction : | - |
Chain : | J |
---|---|
UniProt : | A0A371CB65 (A0A371CB65_YARLL) |
Reaction : | - |
Chain : | K |
---|---|
UniProt : | Q9UUT7 (Q9UUT7_YARLL) |
Reaction : | - |
Chain : | L | ||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
UniProt : | Q9B6D4 (NU4LM_YARLI) | ||||||||
|
Chain : | M |
---|---|
UniProt : | A0A1H6Q8Z5 (A0A1H6Q8Z5_YARLL) |
Reaction : | - |
Chain : | O |
---|---|
UniProt : | A0A1H6PXT9 (A0A1H6PXT9_YARLL) |
Reaction : | - |
Chain : | P |
---|---|
UniProt : | A0A1D8N3C8 (A0A1D8N3C8_YARLL) |
Reaction : | - |
Chain : | Q |
---|---|
UniProt : | A0A1D8NG21 (A0A1D8NG21_YARLL) |
Reaction : | - |
Chain : | R |
---|---|
UniProt : | A0A1D8NDL1 (A0A1D8NDL1_YARLL) |
Reaction : | - |
Chain : | S |
---|---|
UniProt : | Q6ZY23 (Q6ZY23_YARLL) |
Reaction : | - |
Chain : | U |
---|---|
UniProt : | A0A371C2D0 (A0A371C2D0_YARLL) |
Reaction : | - |
Chain : | W |
---|---|
UniProt : | A0A1H6PPE5 (A0A1H6PPE5_YARLL) |
Reaction : | - |
Chain : | X |
---|---|
UniProt : | A0A1D8NKB4 (A0A1D8NKB4_YARLL) |
Reaction : | - |
Chain : | Y |
---|---|
UniProt : | A0A1D8N7X0 (A0A1D8N7X0_YARLL) |
Reaction : | - |
Chain : | Z |
---|---|
UniProt : | A0A1D8N3H5 (A0A1D8N3H5_YARLL) |
Reaction : | - |
Chain : | a |
---|---|
UniProt : | A0A1D8ND94 (A0A1D8ND94_YARLL) |
Reaction : | - |
Chain : | b |
---|---|
UniProt : | A0A1D8NGI5 (A0A1D8NGI5_YARLL) |
Reaction : | - |
Chain : | c |
---|---|
UniProt : | A0A371C0F2 (A0A371C0F2_YARLL) |
Reaction : | - |
Chain : | d |
---|---|
UniProt : | A0A1D8N596 (A0A1D8N596_YARLL) |
Reaction : | - |
Chain : | e |
---|---|
UniProt : | A0A1D8NFX6 (A0A1D8NFX6_YARLL) |
Reaction : | - |
Chain : | f |
---|---|
UniProt : | A0A1H6PJS3 (A0A1H6PJS3_YARLL) |
Reaction : | - |
Chain : | g |
---|---|
UniProt : | A0A1D8NJR0 (A0A1D8NJR0_YARLL) |
Reaction : | - |
Chain : | h |
---|---|
UniProt : | A0A1D8N5V2 (A0A1D8N5V2_YARLL) |
Reaction : | - |
Chain : | i |
---|---|
UniProt : | A0A1H6Q311 (A0A1H6Q311_YARLL) |
Reaction : | - |
Chain : | j |
---|---|
UniProt : | Q6ZY24 (Q6ZY24_YARLL) |
Reaction : | - |
Chain : | n |
---|---|
UniProt : | A0A371CFV9 (A0A371CFV9_YARLL) |
Reaction : | - |
Chain : | 1 | ||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
UniProt : | S5U3V2 (S5U3V2_YARLL) | ||||||||
|
Chain : | 2 | ||||||||
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UniProt : | S5U4R9 (S5U4R9_YARLL) | ||||||||
|
Chain : | 3 | ||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
UniProt : | S5TMS4 (S5TMS4_YARLL) | ||||||||
|
Chain : | 4 | ||||||||
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UniProt : | S5TMP9 (S5TMP9_YARLL) | ||||||||
|
Chain : | 5 | ||||||||
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UniProt : | S5TF58 (S5TF58_YARLL) | ||||||||
|
Chain : | 6 | ||||||||
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UniProt : | Q9B6E9 (NU6M_YARLI) | ||||||||
|
Chain : | 8 |
---|---|
UniProt : | A0A1H6PKH9 (A0A1H6PKH9_YARLL) |
Reaction : | - |
Chain : | 9 |
---|---|
UniProt : | A0A1D8NNZ0 (A0A1D8NNZ0_YARLL) |
Reaction : | - |