PDB ID: 5BR8
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Code | Name | Style | Show | Link | |
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MG | Magnesium ion | PoSSuM | |||
PAR | Paromomycin | PoSSuM | |||
ZN | Zinc ion | PoSSuM |
Code | Name | Show |
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0TD | (3s)-3-(methylsulfanyl)-L-aspartic acid | |
2MG | 2n-methylguanosine-5'-monophosphate | |
4OC | 4n,o2'-methylcytidine-5'-monophosphate | |
5MC | 5-methylcytidine-5'-monophosphate | |
G7M | N7-methyl-guanosine-5'-monophosphate | |
M2G | N2-dimethylguanosine-5'-monophosphate | |
MA6 | 6n-dimethyladenosine-5'-monophoshate | |
PSU | Pseudouridine-5'-monophosphate | |
UR3 | 3-methyluridine-5'-monophoshate |
Code | Name | Emphasize |
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Code | Name | Show |
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Download interaction data: 5BR8
Structure summary
Code : | 5BR8 PDBj RCSB PDB PDBe | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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Header : | RIBOSOME | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Title : | Ambient-temperature crystal structure of 30S ribosomal subunit from Thermus thermophilus in complex with paromomycin | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Release Data : | 2015-11-18 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Compound : |
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Source : |
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Authors : | Sierra, R.G., Gati, C., Laksmono, H., Dao, E.H., Gul, S., Fuller, F., Kern, J., Chatterjee, R., Ibrahim, M., Brewster, A., Young, I.D., Michels-Clark, T., Aquila, A., Mengning, L., Hunter, M.S., Koglin, J.E., Boutet, S., Junco, E.A., Hayes, B., Bogan, M.J., Hampton, C.Y., Puglisi, E.V., Sauter, N.K., Stan, C.A., Zouni, A., Yano, J., Yachandra, V.K., Soltis, S.M., Puglisi, J.D., DeMirci, H. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Keywords : | 30S ribosomal subunit, Paromomycin, Ambient temperature, SFX, electrospinning, RIBOSOME | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Exp. method : | X-RAY DIFFRACTION ( 3.400 Å ) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Citation : |
Ambient-temperature crystal structure of 30S ribosomal subunit from Thermus thermophilus in complex with paromomycin
Sierra, R.G.,Gati, C.,Laksmono, H.
et al.
|
Reaction
Chain : | B |
---|---|
UniProt : | P80371 (RS2_THET8) |
Reaction : | - |
Chain : | C |
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UniProt : | P80372 (RS3_THET8) |
Reaction : | - |
Chain : | D |
---|---|
UniProt : | P80373 (RS4_THET8) |
Reaction : | - |
Chain : | E |
---|---|
UniProt : | Q5SHQ5 (RS5_THET8) |
Reaction : | - |
Chain : | F |
---|---|
UniProt : | Q5SLP8 (RS6_THET8) |
Reaction : | - |
Chain : | G |
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UniProt : | P17291 (RS7_THET8) |
Reaction : | - |
Chain : | H |
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UniProt : | Q5SHQ2 (RS8_THET8) |
Reaction : | - |
Chain : | I |
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UniProt : | P80374 (RS9_THET8) |
Reaction : | - |
Chain : | J |
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UniProt : | Q5SHN7 (RS10_THET8) |
Reaction : | - |
Chain : | K |
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UniProt : | P80376 (RS11_THET8) |
Reaction : | - |
Chain : | L |
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UniProt : | Q5SHN3 (RS12_THET8) |
Reaction : | - |
Chain : | M |
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UniProt : | P80377 (RS13_THET8) |
Reaction : | - |
Chain : | N |
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UniProt : | Q5SHQ1 (RS14Z_THET8) |
Reaction : | - |
Chain : | O |
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UniProt : | Q5SJ76 (RS15_THET8) |
Reaction : | - |
Chain : | P |
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UniProt : | Q5SJH3 (RS16_THET8) |
Reaction : | - |
Chain : | Q |
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UniProt : | Q5SHP7 (RS17_THET8) |
Reaction : | - |
Chain : | R |
---|---|
UniProt : | Q5SLQ0 (RS18_THET8) |
Reaction : | - |
Chain : | S |
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UniProt : | Q5SHP2 (RS19_THET8) |
Reaction : | - |
Chain : | T |
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UniProt : | P80380 (RS20_THET8) |
Reaction : | - |
Chain : | U |
---|---|
UniProt : | Q5SIH3 (RSHX_THET8) |
Reaction : | - |