PDB ID: 3JCU
Hetero Atom Contents
The number of atoms exceeds 100,000. So, it can not be displayed here.
Select unit:
Select hetatm:
Select chain: Sequence
Data format:
Color scheme of protein:
Code | Name | Style | Show | Link | |
---|---|---|---|---|---|
BCR | Beta-carotene | PoSSuM | |||
BCT | Bicarbonate ion | PoSSuM | |||
CHL | Chlorophyll B | PoSSuM | |||
CL | Chloride ion | PoSSuM | |||
CLA | Chlorophyll a | PoSSuM | |||
FE2 | Fe (II) ion | PoSSuM | |||
HEM | Protoporphyrin ix containing Fe | PoSSuM | |||
LHG | 1,2-dipalmitoyl-phosphatidyl-glycerole | PoSSuM | |||
LMG | 1,2-distearoyl-monogalactosyl-diglyceride | PoSSuM | |||
LUT | (3r,3'R,6s)-4,5-didehydro-5,6-dihydro-beta,beta-carotene-3,3'-diol | PoSSuM | |||
NEX | (1r,3r)-6-{(3e,5e,7e,9e,11e,13e,15e,17e)-18-[(1s,4r,6r)-4-hydroxy-2,2,6-trimethyl-7-oxabicyclo[4.1.0]hept-1-yl]-3,7,12,16-tetramethyloctadeca-1,3,5,7,9,11,13,15,17-nonaenylidene}-1,5,5-trimethylcyclohexane-1,3-diol | PoSSuM | |||
OEX | Ca-mn4-o5 cluster | PoSSuM | |||
PHO | Pheophytin a | PoSSuM | |||
PL9 | 2,3-dimethyl-5-(3,7,11,15,19,23,27,31,35-nonamethyl-2,6,10,14,18,22,26,30,34-hexatriacontanonaenyl-2,5-cyclohexadiene-1,4-dione-2,3-dimethyl-5-solanesyl-1,4-benzoquinone | PoSSuM | |||
SQD | 1,2-di-O-acyl-3-O-[6-deoxy-6-sulfo-alpha-D-glucopyranosyl]-sn-glycerol | PoSSuM | |||
XAT | (3s,5r,6s,3'S,5'R,6'S)-5,6,5',6'-diepoxy-5,6,5',6'- tetrahydro-beta,beta-carotene-3,3'-diol | PoSSuM | |||
DGD | Digalactosyl diacyl glycerol (dgdg) | PoSSuM |
Code | Name | Show |
---|
Code | Name | Emphasize |
---|
Code | Name | Show |
---|
Download interaction data: 3JCU
Structure summary
Code : | 3JCU PDBj RCSB PDB PDBe | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
Header : | MEMBRANE PROTEIN | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Title : | Cryo-EM structure of spinach PSII-LHCII supercomplex at 3.2 Angstrom resolution | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Release Data : | 2016-05-25 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Compound : |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Source : |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Authors : | Wei, X.P., Zhang, X.Z., Su, X.D., Cao, P., Liu, X.Y., Li, M., Chang, W.R., Liu, Z.F. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Keywords : | membrane protein | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Exp. method : | ELECTRON MICROSCOPY ( 3.2 Å ) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Citation : |
Structure of spinach photosystem II-LHCII supercomplex at 3.2 A resolution
Wei, X.P.,Su, X.D.,Cao, P.
et al.
DOI: 10.1038/nature18020 |
Reaction
Chain : | A, a | ||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
UniProt : | P69560 (PSBA_SPIOL) | ||||||||
|
Chain : | B, b |
---|---|
UniProt : | P04160 (PSBB_SPIOL) |
Reaction : | - |
Chain : | C, c |
---|---|
UniProt : | P06003 (PSBC_SPIOL) |
Reaction : | - |
Chain : | D, d | ||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
UniProt : | P06005 (PSBD_SPIOL) | ||||||||
|
Chain : | E, e |
---|---|
UniProt : | P69383 (PSBE_SPIOL) |
Reaction : | - |
Chain : | F, f |
---|---|
UniProt : | P60128 (PSBF_SPIOL) |
Reaction : | - |
Chain : | G, N, Y, g, n, y |
---|---|
UniProt : | P12333 (CB2A_SPIOL) |
Reaction : | - |
Chain : | H, h |
---|---|
UniProt : | P05146 (PSBH_SPIOL) |
Reaction : | - |
Chain : | I, i |
---|---|
UniProt : | P62103 (PSBI_SPIOL) |
Reaction : | - |
Chain : | J, j |
---|---|
UniProt : | Q9M3L2 (PSBJ_SPIOL) |
Reaction : | - |
Chain : | K, k |
---|---|
UniProt : | P12163 (PSBK_SPIOL) |
Reaction : | - |
Chain : | L, l |
---|---|
UniProt : | P60150 (PSBL_SPIOL) |
Reaction : | - |
Chain : | M, m |
---|---|
UniProt : | P62112 (PSBM_SPIOL) |
Reaction : | - |
Chain : | O, o |
---|---|
UniProt : | P12359 (PSBO_SPIOL) |
Reaction : | - |
Chain : | P, p |
---|---|
UniProt : | P12302 (PSBP_SPIOL) |
Reaction : | - |
Chain : | Q, q |
---|---|
UniProt : | P12301 (PSBQ_SPIOL) |
Reaction : | - |
Chain : | R, r |
---|---|
UniProt : | F2Z293 (F2Z293_SPIOL) |
Reaction : | - |
Chain : | S, s |
---|---|
UniProt : | A0A0K9QUQ7 |
Reaction : | - |
Chain : | T, t |
---|---|
UniProt : | P61840 (PSBT_SPIOL) |
Reaction : | - |
Chain : | U, u |
---|---|
UniProt : | A0A0K9RHP1 |
Reaction : | - |
Chain : | W, w |
---|---|
UniProt : | Q41387 (PSBW_SPIOL) |
Reaction : | - |
Chain : | X, x |
---|---|
UniProt : | A0A0K9RTU3 |
Reaction : | - |
Chain : | Z, z |
---|---|
UniProt : | Q9M3M6 (PSBZ_SPIOL) |
Reaction : | - |