data_UDG # _chem_comp.id UDG _chem_comp.name ;(2R,3R,4R,5S,6R)-2-{[(S)-{[(S)-{[(2R,3S,4R,5R)-5-(2,4-dioxo-3,4-dihydropyrimidin-1(2H)-yl)-3,4-dihydroxytetrahydrofuran-2-yl]methoxy}(hydroxy)phosphoryl]oxy}(hydroxy)phosphoryl]oxy}-5-hydroxy-6-(hydroxymethyl)-3-{[(3R)-3-hydroxytetradecanoyl]amino}tetrahydro-2H-pyran-4-yl (3R)-3-hydroxytetradecanoate ; _chem_comp.type NON-POLYMER _chem_comp.pdbx_type HETAIN _chem_comp.formula "C43 H77 N3 O20 P2" _chem_comp.mon_nstd_parent_comp_id ? _chem_comp.pdbx_synonyms ? _chem_comp.pdbx_formal_charge 0 _chem_comp.pdbx_initial_date 2012-08-08 _chem_comp.pdbx_modified_date 2012-09-28 _chem_comp.pdbx_ambiguous_flag N _chem_comp.pdbx_release_status REL _chem_comp.pdbx_replaced_by ? _chem_comp.pdbx_replaces ? _chem_comp.formula_weight 1018.027 _chem_comp.one_letter_code ? _chem_comp.three_letter_code UDG _chem_comp.pdbx_model_coordinates_details ? _chem_comp.pdbx_model_coordinates_missing_flag N _chem_comp.pdbx_ideal_coordinates_details Corina _chem_comp.pdbx_ideal_coordinates_missing_flag N _chem_comp.pdbx_model_coordinates_db_code 4GGI _chem_comp.pdbx_subcomponent_list ? _chem_comp.pdbx_processing_site RCSB # loop_ _chem_comp_atom.comp_id _chem_comp_atom.atom_id _chem_comp_atom.alt_atom_id _chem_comp_atom.type_symbol _chem_comp_atom.charge _chem_comp_atom.pdbx_align _chem_comp_atom.pdbx_aromatic_flag _chem_comp_atom.pdbx_leaving_atom_flag _chem_comp_atom.pdbx_stereo_config _chem_comp_atom.model_Cartn_x _chem_comp_atom.model_Cartn_y _chem_comp_atom.model_Cartn_z _chem_comp_atom.pdbx_model_Cartn_x_ideal _chem_comp_atom.pdbx_model_Cartn_y_ideal _chem_comp_atom.pdbx_model_Cartn_z_ideal _chem_comp_atom.pdbx_component_atom_id _chem_comp_atom.pdbx_component_comp_id _chem_comp_atom.pdbx_ordinal UDG N1 N1 N 0 1 N N N -15.504 38.778 -6.425 9.288 -1.006 -2.311 N1 UDG 1 UDG C2 C2 C 0 1 N N N -16.083 38.256 -7.609 9.760 -2.197 -1.900 C2 UDG 2 UDG O2 O2 O 0 1 N N N -16.904 39.036 -8.379 9.113 -3.204 -2.115 O2 UDG 3 UDG N3 N3 N 0 1 N N N -15.834 36.973 -7.967 10.938 -2.290 -1.255 N3 UDG 4 UDG C4 C4 C 0 1 N N N -15.031 36.194 -7.211 11.667 -1.183 -1.010 C4 UDG 5 UDG O4 O4 O 0 1 N N N -14.793 34.909 -7.591 12.733 -1.266 -0.427 O4 UDG 6 UDG C5 C5 C 0 1 N N N -14.452 36.701 -6.052 11.182 0.077 -1.436 C5 UDG 7 UDG C6 C6 C 0 1 N N N -14.702 38.015 -5.676 10.000 0.141 -2.086 C6 UDG 8 UDG PA PA P 0 1 N N N -13.024 41.685 -1.231 3.204 -3.381 -0.701 PA UDG 9 UDG PB PB P 0 1 N N N -10.128 41.342 -1.094 1.906 -2.911 1.922 PB UDG 10 UDG "C1'" "C1'" C 0 1 N N R -9.613 38.779 -1.120 0.285 -1.676 3.651 "C1'" UDG 11 UDG C11 C1* C 0 1 N N R -15.745 40.167 -6.029 8.003 -0.937 -3.011 C1* UDG 12 UDG O1A O1A O 0 1 N N N -12.788 42.895 -0.336 1.990 -3.806 -1.668 O1A UDG 13 UDG O1B O1B O 0 1 N N N -9.822 41.270 0.391 3.011 -3.378 2.995 O1B UDG 14 UDG "C2'" "C2'" C 0 1 N N R -8.400 37.845 -1.157 -0.839 -0.645 3.518 "C2'" UDG 15 UDG C12 C2* C 0 1 N N R -16.412 40.301 -4.669 8.064 -1.742 -4.328 C2* UDG 16 UDG "O2'" O2* O 0 1 N N N -17.840 40.236 -4.794 8.304 -0.873 -5.436 O2* UDG 17 UDG O2A O2A O 0 1 N N N -14.097 40.666 -0.903 3.877 -4.597 -0.191 O2A UDG 18 UDG O2B O2B O 0 1 N N N -9.862 42.633 -1.843 0.949 -4.016 1.687 O2B UDG 19 UDG "C3'" "C3'" C 0 1 N N R -7.976 37.682 -2.604 -0.228 0.758 3.441 "C3'" UDG 20 UDG C13 C3* C 0 1 N N S -15.918 41.661 -4.201 6.665 -2.387 -4.438 C3* UDG 21 UDG "O3'" O3* O 0 1 N N N -16.754 42.707 -4.719 5.998 -1.938 -5.620 O3* UDG 22 UDG N34 N34 N 0 1 N N N -7.290 38.309 -0.345 -1.607 -0.912 2.299 N34 UDG 23 UDG C35 C35 C 0 1 N N N -7.330 38.284 0.977 -2.610 -1.811 2.318 C35 UDG 24 UDG O36 O36 O 0 1 N N N -7.466 37.258 1.626 -2.878 -2.399 3.344 O36 UDG 25 UDG C37 C37 C 0 1 N N N -7.203 39.618 1.669 -3.400 -2.085 1.064 C37 UDG 26 UDG C38 C38 C 0 1 N N R -7.107 39.349 3.164 -4.471 -3.138 1.356 C38 UDG 27 UDG C39 C39 C 0 1 N N N -5.640 39.165 3.524 -5.352 -3.326 0.119 C39 UDG 28 UDG O3A O3A O 0 1 N N N -11.639 40.851 -1.459 2.631 -2.526 0.537 O3A UDG 29 UDG O3B O3B O 0 1 N N N -9.394 40.052 -1.743 1.115 -1.628 2.489 O3B UDG 30 UDG "C4'" "C4'" C 0 1 N N S -9.139 37.119 -3.396 0.635 0.995 4.685 "C4'" UDG 31 UDG "O4'" "O4'" O 0 1 N N N -8.766 37.273 -4.760 1.268 2.273 4.589 "O4'" UDG 32 UDG C14 C4* C 0 1 N N R -14.527 41.779 -4.812 5.924 -1.895 -3.175 C4* UDG 33 UDG O14 O4* O 0 1 N N N -14.507 40.893 -5.943 6.971 -1.579 -2.232 O4* UDG 34 UDG C40 C40 C 0 1 N N N -5.483 38.173 4.669 -6.498 -4.285 0.450 C40 UDG 35 UDG C41 C41 C 0 1 N N N -5.488 38.844 6.041 -7.379 -4.472 -0.786 C41 UDG 36 UDG C42 C42 C 0 1 N N N -5.613 37.808 7.160 -8.524 -5.431 -0.456 C42 UDG 37 UDG C43 C43 C 0 1 N N N -4.386 36.903 7.191 -9.406 -5.619 -1.692 C43 UDG 38 UDG C44 C44 C 0 1 N N N -4.658 35.594 7.920 -10.551 -6.578 -1.362 C44 UDG 39 UDG C45 C45 C 0 1 N N N -3.411 34.722 7.803 -11.432 -6.765 -2.598 C45 UDG 40 UDG C46 C46 C 0 1 N N N -3.646 33.283 8.249 -12.578 -7.724 -2.268 C46 UDG 41 UDG C47 C47 C 0 1 N N N -2.837 32.972 9.504 -13.459 -7.912 -3.504 C47 UDG 42 UDG C48 C48 C 0 1 N N N -3.362 31.722 10.200 -14.604 -8.871 -3.174 C48 UDG 43 UDG C49 C49 C 0 1 N N N -2.696 31.562 11.548 -15.485 -9.059 -4.410 C49 UDG 44 UDG "C5'" "C5'" C 0 1 N N R -10.457 37.849 -3.153 1.702 -0.100 4.772 "C5'" UDG 45 UDG "O5'" "O5'" O 0 1 N N N -10.709 38.128 -1.775 1.067 -1.380 4.809 "O5'" UDG 46 UDG C15 C5* C 0 1 N N N -13.423 41.387 -3.834 5.023 -3.000 -2.621 C5* UDG 47 UDG O15 O5* O 0 1 N N N -13.404 42.254 -2.700 4.261 -2.489 -1.526 O5* UDG 48 UDG O50 O50 O 0 1 N N N -7.658 40.456 3.892 -3.843 -4.378 1.686 O50 UDG 49 UDG O51 O51 O 0 1 N N N -6.936 36.722 -2.766 -1.289 1.747 3.388 O51 UDG 50 UDG C52 C52 C 0 1 N N N -5.577 37.231 -2.721 -1.028 2.886 2.728 C52 UDG 51 UDG O53 O53 O 0 1 N N N -5.308 38.365 -3.096 0.052 3.050 2.211 O53 UDG 52 UDG C54 C54 C 0 1 N N N -4.512 36.293 -2.214 -2.081 3.960 2.631 C54 UDG 53 UDG C55 C55 C 0 1 N N R -4.939 35.798 -0.832 -1.531 5.143 1.831 C55 UDG 54 UDG C56 C56 C 0 1 N N N -4.189 34.508 -0.494 -2.638 6.178 1.626 C56 UDG 55 UDG C57 C57 C 0 1 N N N -4.221 34.202 1.004 -2.125 7.301 0.722 C57 UDG 56 UDG C58 C58 C 0 1 N N N -3.064 34.862 1.756 -3.232 8.337 0.517 C58 UDG 57 UDG C59 C59 C 0 1 N N N -2.896 34.258 3.145 -2.719 9.460 -0.387 C59 UDG 58 UDG "C6'" "C6'" C 0 1 N N N -11.630 37.079 -3.762 2.530 0.096 6.043 "C6'" UDG 59 UDG "O6'" "O6'" O 0 1 N N N -11.357 35.676 -3.742 3.598 -0.853 6.067 "O6'" UDG 60 UDG C60 C60 C 0 1 N N N -3.069 32.739 3.128 -3.826 10.496 -0.592 C60 UDG 61 UDG C61 C61 C 0 1 N N N -1.808 32.021 3.609 -3.313 11.619 -1.495 C61 UDG 62 UDG C62 C62 C 0 1 N N N -1.885 31.499 5.044 -4.421 12.654 -1.701 C62 UDG 63 UDG C63 C63 C 0 1 N N N -2.228 30.010 5.077 -3.907 13.777 -2.604 C63 UDG 64 UDG C64 C64 C 0 1 N N N -1.082 29.157 5.621 -5.015 14.813 -2.810 C64 UDG 65 UDG C65 C65 C 0 1 N N N -1.591 27.899 6.333 -4.502 15.936 -3.713 C65 UDG 66 UDG C66 C66 C 0 1 N N N -0.507 26.841 6.434 -5.609 16.972 -3.919 C66 UDG 67 UDG O67 O67 O 0 1 N N N -4.660 36.817 0.141 -0.448 5.739 2.548 O67 UDG 68 UDG H5 H5 H 0 1 N N N -13.811 36.076 -5.447 11.753 0.975 -1.248 H5 UDG 69 UDG H6 H6 H 0 1 N N N -14.250 38.418 -4.782 9.617 1.092 -2.422 H6 UDG 70 UDG "H1'" "H1'" H 0 1 N N N -9.876 38.941 -0.064 -0.146 -2.673 3.748 "H1'" UDG 71 UDG "H1'A" H1* H 0 0 N N N -16.394 40.644 -6.778 7.737 0.101 -3.211 H1* UDG 72 UDG HO1A HO1A H 0 0 N N N -13.396 42.873 0.394 1.503 -3.058 -2.040 HO1A UDG 73 UDG HO1B HO1B H 0 0 N N N -9.477 42.105 0.685 3.672 -2.702 3.198 HO1B UDG 74 UDG "H2'" "H2'" H 0 1 N N N -8.723 36.861 -0.786 -1.497 -0.710 4.384 "H2'" UDG 75 UDG "H2'A" H2* H 0 0 N N N -16.039 39.517 -3.993 8.835 -2.511 -4.270 H2* UDG 76 UDG "HO2'" HO2* H 0 0 N N N -18.238 40.321 -3.935 8.352 -1.327 -6.289 HO2* UDG 77 UDG "H3'" "H3'" H 0 1 N N N -7.682 38.658 -3.018 0.391 0.838 2.547 "H3'" UDG 78 UDG "H3'A" H3* H 0 0 N N N -15.859 41.692 -3.103 6.744 -3.474 -4.435 H3* UDG 79 UDG "HO3'" HO3* H 0 0 N N N -16.432 43.549 -4.418 6.454 -2.170 -6.441 HO3* UDG 80 UDG HN34 HN34 H 0 0 N N N -6.470 38.658 -0.799 -1.393 -0.441 1.478 HN34 UDG 81 UDG H37 H37 H 0 1 N N N -6.297 40.137 1.322 -3.877 -1.165 0.727 H37 UDG 82 UDG H37A H37A H 0 0 N N N -8.086 40.238 1.455 -2.731 -2.454 0.287 H37A UDG 83 UDG H38 H38 H 0 1 N N N -7.655 38.425 3.400 -5.086 -2.808 2.194 H38 UDG 84 UDG H39 H39 H 0 1 N N N -5.097 38.789 2.644 -5.761 -2.362 -0.185 H39 UDG 85 UDG H39A H39A H 0 0 N N N -5.219 40.135 3.827 -4.755 -3.740 -0.693 H39A UDG 86 UDG "H4'" "H4'" H 0 1 N N N -9.266 36.055 -3.148 0.007 0.964 5.575 "H4'" UDG 87 UDG "HO4'" "HO4'" H 0 0 N N N -9.458 36.937 -5.318 1.832 2.489 5.345 "HO4'" UDG 88 UDG "H4'A" H4* H 0 0 N N N -14.365 42.817 -5.138 5.336 -1.005 -3.403 H4* UDG 89 UDG H40 H40 H 0 1 N N N -6.314 37.454 4.627 -6.089 -5.248 0.755 H40 UDG 90 UDG H40A H40A H 0 0 N N N -4.530 37.639 4.543 -7.095 -3.871 1.263 H40A UDG 91 UDG H41 H41 H 0 1 N N N -4.549 39.402 6.171 -7.788 -3.509 -1.091 H41 UDG 92 UDG H41A H41A H 0 0 N N N -6.339 39.539 6.098 -6.782 -4.886 -1.599 H41A UDG 93 UDG H42 H42 H 0 1 N N N -5.704 38.327 8.125 -8.115 -6.394 -0.151 H42 UDG 94 UDG H42A H42A H 0 0 N N N -6.510 37.195 6.987 -9.122 -5.017 0.356 H42A UDG 95 UDG H43 H43 H 0 1 N N N -4.085 36.677 6.157 -9.814 -4.655 -1.997 H43 UDG 96 UDG H43A H43A H 0 0 N N N -3.569 37.431 7.704 -8.808 -6.033 -2.505 H43A UDG 97 UDG H44 H44 H 0 1 N N N -4.875 35.795 8.979 -10.142 -7.541 -1.057 H44 UDG 98 UDG H44A H44A H 0 0 N N N -5.516 35.082 7.460 -11.148 -6.164 -0.549 H44A UDG 99 UDG H45 H45 H 0 1 N N N -3.086 34.715 6.752 -11.841 -5.802 -2.903 H45 UDG 100 UDG H45A H45A H 0 0 N N N -2.618 35.158 8.429 -10.835 -7.180 -3.411 H45A UDG 101 UDG H46 H46 H 0 1 N N N -4.715 33.141 8.464 -12.169 -8.688 -1.963 H46 UDG 102 UDG H46A H46A H 0 0 N N N -3.340 32.600 7.443 -13.175 -7.310 -1.455 H46A UDG 103 UDG H47 H47 H 0 1 N N N -1.786 32.812 9.223 -13.868 -6.949 -3.809 H47 UDG 104 UDG H47A H47A H 0 0 N N N -2.906 33.824 10.196 -12.861 -8.326 -4.317 H47A UDG 105 UDG H48 H48 H 0 1 N N N -4.449 31.812 10.339 -14.195 -9.834 -2.869 H48 UDG 106 UDG H48A H48A H 0 0 N N N -3.144 30.841 9.579 -15.202 -8.457 -2.361 H48A UDG 107 UDG H49 H49 H 0 1 N N N -3.081 30.658 12.043 -14.888 -9.473 -5.222 H49 UDG 108 UDG H49A H49A H 0 0 N N N -1.608 31.470 11.411 -16.301 -9.742 -4.175 H49A UDG 109 UDG H49B H49B H 0 0 N N N -2.914 32.442 12.171 -15.894 -8.095 -4.715 H49B UDG 110 UDG "H5'" "H5'" H 0 1 N N N -10.394 38.808 -3.688 2.354 -0.042 3.901 "H5'" UDG 111 UDG "H5'A" H5* H 0 0 N N N -13.595 40.355 -3.494 4.347 -3.345 -3.404 H5* UDG 112 UDG H5AA H5*A H 0 0 N N N -12.452 41.446 -4.347 5.638 -3.832 -2.279 H5*A UDG 113 UDG HO50 HO50 H 0 0 N N N -7.596 40.285 4.824 -3.279 -4.732 0.985 HO50 UDG 114 UDG H54 H54 H 0 1 N N N -4.408 35.440 -2.901 -2.962 3.560 2.128 H54 UDG 115 UDG H54A H54A H 0 0 N N N -3.551 36.824 -2.140 -2.353 4.293 3.632 H54A UDG 116 UDG H55 H55 H 0 1 N N N -6.018 35.583 -0.852 -1.176 4.793 0.862 H55 UDG 117 UDG H56 H56 H 0 1 N N N -4.656 33.673 -1.037 -3.500 5.701 1.159 H56 UDG 118 UDG H56A H56A H 0 0 N N N -3.141 34.612 -0.813 -2.931 6.593 2.590 H56A UDG 119 UDG H57 H57 H 0 1 N N N -5.170 34.571 1.420 -1.263 7.779 1.190 H57 UDG 120 UDG H57A H57A H 0 0 N N N -4.158 33.113 1.144 -1.832 6.887 -0.242 H57A UDG 121 UDG H58 H58 H 0 1 N N N -2.135 34.715 1.186 -4.094 7.860 0.050 H58 UDG 122 UDG H58A H58A H 0 0 N N N -3.267 35.939 1.855 -3.525 8.752 1.481 H58A UDG 123 UDG H59 H59 H 0 1 N N N -1.889 34.498 3.518 -1.857 9.937 0.081 H59 UDG 124 UDG H59A H59A H 0 0 N N N -3.650 34.695 3.817 -2.426 9.045 -1.351 H59A UDG 125 UDG "H6'" "H6'" H 0 1 N N N -12.541 37.281 -3.179 2.941 1.105 6.058 "H6'" UDG 126 UDG "H6'A" "H6'A" H 0 0 N N N -11.780 37.406 -4.801 1.895 -0.050 6.917 "H6'A" UDG 127 UDG "HO6'" "HO6'" H 0 0 N N N -12.090 35.205 -4.122 4.166 -0.787 6.847 "HO6'" UDG 128 UDG H60 H60 H 0 1 N N N -3.907 32.468 3.787 -4.688 10.019 -1.059 H60 UDG 129 UDG H60A H60A H 0 0 N N N -3.292 32.417 2.100 -4.119 10.910 0.373 H60A UDG 130 UDG H61 H61 H 0 1 N N N -1.623 31.166 2.942 -2.452 12.096 -1.028 H61 UDG 131 UDG H61A H61A H 0 0 N N N -0.966 32.725 3.544 -3.020 11.204 -2.460 H61A UDG 132 UDG H62 H62 H 0 1 N N N -0.912 31.653 5.534 -5.282 12.177 -2.168 H62 UDG 133 UDG H62A H62A H 0 0 N N N -2.662 32.057 5.587 -4.714 13.069 -0.736 H62A UDG 134 UDG H63 H63 H 0 1 N N N -3.110 29.865 5.718 -3.046 14.254 -2.137 H63 UDG 135 UDG H63A H63A H 0 0 N N N -2.460 29.679 4.054 -3.614 13.363 -3.569 H63A UDG 136 UDG H64 H64 H 0 1 N N N -0.436 28.854 4.784 -5.876 14.336 -3.277 H64 UDG 137 UDG H64A H64A H 0 0 N N N -0.500 29.758 6.335 -5.308 15.228 -1.845 H64A UDG 138 UDG H65 H65 H 0 1 N N N -1.921 28.171 7.347 -3.640 16.413 -3.246 H65 UDG 139 UDG H65A H65A H 0 0 N N N -2.441 27.488 5.768 -4.209 15.521 -4.678 H65A UDG 140 UDG H66 H66 H 0 1 N N N -0.906 25.955 6.949 -5.243 17.772 -4.562 H66 UDG 141 UDG H66A H66A H 0 0 N N N -0.174 26.559 5.424 -6.470 16.494 -4.386 H66A UDG 142 UDG H66B H66B H 0 0 N N N 0.345 27.242 7.002 -5.902 17.386 -2.954 H66B UDG 143 UDG HO67 HO67 H 0 0 N N N -4.924 36.514 1.002 -0.691 6.074 3.422 HO67 UDG 144 UDG HN3 HN3 H 0 1 N N N -16.248 36.600 -8.797 11.263 -3.157 -0.966 HN3 UDG 145 # loop_ _chem_comp_bond.comp_id _chem_comp_bond.atom_id_1 _chem_comp_bond.atom_id_2 _chem_comp_bond.value_order _chem_comp_bond.pdbx_aromatic_flag _chem_comp_bond.pdbx_stereo_config _chem_comp_bond.pdbx_ordinal UDG C2 N1 SING N N 1 UDG N1 C11 SING N N 2 UDG N1 C6 SING N N 3 UDG O2 C2 DOUB N N 4 UDG N3 C2 SING N N 5 UDG N3 C4 SING N N 6 UDG O4 C4 DOUB N N 7 UDG C4 C5 SING N N 8 UDG C5 C6 DOUB N N 9 UDG C5 H5 SING N N 10 UDG C6 H6 SING N N 11 UDG O15 PA SING N N 12 UDG O3A PA SING N N 13 UDG PA O2A DOUB N N 14 UDG PA O1A SING N N 15 UDG O2B PB DOUB N N 16 UDG O3B PB SING N N 17 UDG O3A PB SING N N 18 UDG PB O1B SING N N 19 UDG "O5'" "C1'" SING N N 20 UDG O3B "C1'" SING N N 21 UDG "C2'" "C1'" SING N N 22 UDG "C1'" "H1'" SING N N 23 UDG C11 O14 SING N N 24 UDG C11 C12 SING N N 25 UDG C11 "H1'A" SING N N 26 UDG O1A HO1A SING N N 27 UDG O1B HO1B SING N N 28 UDG "C3'" "C2'" SING N N 29 UDG "C2'" N34 SING N N 30 UDG "C2'" "H2'" SING N N 31 UDG "O2'" C12 SING N N 32 UDG C12 C13 SING N N 33 UDG C12 "H2'A" SING N N 34 UDG "O2'" "HO2'" SING N N 35 UDG "C4'" "C3'" SING N N 36 UDG O51 "C3'" SING N N 37 UDG "C3'" "H3'" SING N N 38 UDG C14 C13 SING N N 39 UDG "O3'" C13 SING N N 40 UDG C13 "H3'A" SING N N 41 UDG "O3'" "HO3'" SING N N 42 UDG N34 C35 SING N N 43 UDG N34 HN34 SING N N 44 UDG C35 O36 DOUB N N 45 UDG C35 C37 SING N N 46 UDG C37 C38 SING N N 47 UDG C37 H37 SING N N 48 UDG C37 H37A SING N N 49 UDG C38 C39 SING N N 50 UDG C38 O50 SING N N 51 UDG C38 H38 SING N N 52 UDG C39 C40 SING N N 53 UDG C39 H39 SING N N 54 UDG C39 H39A SING N N 55 UDG "O4'" "C4'" SING N N 56 UDG "C4'" "C5'" SING N N 57 UDG "C4'" "H4'" SING N N 58 UDG "O4'" "HO4'" SING N N 59 UDG O14 C14 SING N N 60 UDG C14 C15 SING N N 61 UDG C14 "H4'A" SING N N 62 UDG C40 C41 SING N N 63 UDG C40 H40 SING N N 64 UDG C40 H40A SING N N 65 UDG C41 C42 SING N N 66 UDG C41 H41 SING N N 67 UDG C41 H41A SING N N 68 UDG C42 C43 SING N N 69 UDG C42 H42 SING N N 70 UDG C42 H42A SING N N 71 UDG C43 C44 SING N N 72 UDG C43 H43 SING N N 73 UDG C43 H43A SING N N 74 UDG C45 C44 SING N N 75 UDG C44 H44 SING N N 76 UDG C44 H44A SING N N 77 UDG C45 C46 SING N N 78 UDG C45 H45 SING N N 79 UDG C45 H45A SING N N 80 UDG C46 C47 SING N N 81 UDG C46 H46 SING N N 82 UDG C46 H46A SING N N 83 UDG C47 C48 SING N N 84 UDG C47 H47 SING N N 85 UDG C47 H47A SING N N 86 UDG C48 C49 SING N N 87 UDG C48 H48 SING N N 88 UDG C48 H48A SING N N 89 UDG C49 H49 SING N N 90 UDG C49 H49A SING N N 91 UDG C49 H49B SING N N 92 UDG "C6'" "C5'" SING N N 93 UDG "C5'" "O5'" SING N N 94 UDG "C5'" "H5'" SING N N 95 UDG C15 O15 SING N N 96 UDG C15 "H5'A" SING N N 97 UDG C15 H5AA SING N N 98 UDG O50 HO50 SING N N 99 UDG O51 C52 SING N N 100 UDG O53 C52 DOUB N N 101 UDG C52 C54 SING N N 102 UDG C54 C55 SING N N 103 UDG C54 H54 SING N N 104 UDG C54 H54A SING N N 105 UDG C55 C56 SING N N 106 UDG C55 O67 SING N N 107 UDG C55 H55 SING N N 108 UDG C56 C57 SING N N 109 UDG C56 H56 SING N N 110 UDG C56 H56A SING N N 111 UDG C57 C58 SING N N 112 UDG C57 H57 SING N N 113 UDG C57 H57A SING N N 114 UDG C58 C59 SING N N 115 UDG C58 H58 SING N N 116 UDG C58 H58A SING N N 117 UDG C60 C59 SING N N 118 UDG C59 H59 SING N N 119 UDG C59 H59A SING N N 120 UDG "C6'" "O6'" SING N N 121 UDG "C6'" "H6'" SING N N 122 UDG "C6'" "H6'A" SING N N 123 UDG "O6'" "HO6'" SING N N 124 UDG C60 C61 SING N N 125 UDG C60 H60 SING N N 126 UDG C60 H60A SING N N 127 UDG C61 C62 SING N N 128 UDG C61 H61 SING N N 129 UDG C61 H61A SING N N 130 UDG C62 C63 SING N N 131 UDG C62 H62 SING N N 132 UDG C62 H62A SING N N 133 UDG C63 C64 SING N N 134 UDG C63 H63 SING N N 135 UDG C63 H63A SING N N 136 UDG C64 C65 SING N N 137 UDG C64 H64 SING N N 138 UDG C64 H64A SING N N 139 UDG C65 C66 SING N N 140 UDG C65 H65 SING N N 141 UDG C65 H65A SING N N 142 UDG C66 H66 SING N N 143 UDG C66 H66A SING N N 144 UDG C66 H66B SING N N 145 UDG O67 HO67 SING N N 146 UDG N3 HN3 SING N N 147 # loop_ _pdbx_chem_comp_descriptor.comp_id _pdbx_chem_comp_descriptor.type _pdbx_chem_comp_descriptor.program _pdbx_chem_comp_descriptor.program_version _pdbx_chem_comp_descriptor.descriptor UDG SMILES ACDLabs 12.01 "O=C1C=CN(C(=O)N1)C2OC(C(O)C2O)COP(=O)(OP(=O)(OC3OC(C(O)C(OC(=O)CC(O)CCCCCCCCCCC)C3NC(=O)CC(O)CCCCCCCCCCC)CO)O)O" UDG InChI InChI 1.03 ;InChI=1S/C43H77N3O20P2/c1-3-5-7-9-11-13-15-17-19-21-29(48)25-34(51)44-36-40(64-35(52)26-30(49)22-20-18-16-14-12-10-8-6-4-2)38(54)31(27-47)63-42(36)65-68(59,60)66-67(57,58)61-28-32-37(53)39(55)41(62-32)46-24-23-33(50)45-43(46)56/h23-24,29-32,36-42,47-49,53-55H,3-22,25-28H2,1-2H3,(H,44,51)(H,57,58)(H,59,60)(H,45,50,56)/t29-,30-,31-,32-,36-,37-,38-,39-,40-,41-,42-/m1/s1 ; UDG InChIKey InChI 1.03 KOJCFMYSTWNMQW-RUAJDYCTSA-N UDG SMILES_CANONICAL CACTVS 3.370 "CCCCCCCCCCC[C@@H](O)CC(=O)N[C@H]1[C@H](O[C@H](CO)[C@@H](O)[C@@H]1OC(=O)C[C@H](O)CCCCCCCCCCC)O[P](O)(=O)O[P](O)(=O)OC[C@H]2O[C@H]([C@H](O)[C@@H]2O)N3C=CC(=O)NC3=O" UDG SMILES CACTVS 3.370 "CCCCCCCCCCC[CH](O)CC(=O)N[CH]1[CH](O[CH](CO)[CH](O)[CH]1OC(=O)C[CH](O)CCCCCCCCCCC)O[P](O)(=O)O[P](O)(=O)OC[CH]2O[CH]([CH](O)[CH]2O)N3C=CC(=O)NC3=O" UDG SMILES_CANONICAL "OpenEye OEToolkits" 1.7.6 "CCCCCCCCCCC[C@H](CC(=O)N[C@@H]1[C@H]([C@@H]([C@H](O[C@@H]1O[P@](=O)(O)O[P@@](=O)(O)OC[C@@H]2[C@H]([C@H]([C@@H](O2)N3C=CC(=O)NC3=O)O)O)CO)O)OC(=O)C[C@@H](CCCCCCCCCCC)O)O" UDG SMILES "OpenEye OEToolkits" 1.7.6 "CCCCCCCCCCCC(CC(=O)NC1C(C(C(OC1OP(=O)(O)OP(=O)(O)OCC2C(C(C(O2)N3C=CC(=O)NC3=O)O)O)CO)O)OC(=O)CC(CCCCCCCCCCC)O)O" # loop_ _pdbx_chem_comp_identifier.comp_id _pdbx_chem_comp_identifier.type _pdbx_chem_comp_identifier.program _pdbx_chem_comp_identifier.program_version _pdbx_chem_comp_identifier.identifier UDG "SYSTEMATIC NAME" ACDLabs 12.01 ;(2R,3R,4R,5S,6R)-2-{[(S)-{[(S)-{[(2R,3S,4R,5R)-5-(2,4-dioxo-3,4-dihydropyrimidin-1(2H)-yl)-3,4-dihydroxytetrahydrofuran-2-yl]methoxy}(hydroxy)phosphoryl]oxy}(hydroxy)phosphoryl]oxy}-5-hydroxy-6-(hydroxymethyl)-3-{[(3R)-3-hydroxytetradecanoyl]amino}tetrahydro-2H-pyran-4-yl (3R)-3-hydroxytetradecanoate (non-preferred name) ; UDG "SYSTEMATIC NAME" "OpenEye OEToolkits" 1.7.6 ;[(2R,3R,4R,5S,6R)-2-[[[(2R,3S,4R,5R)-5-[2,4-bis(oxidanylidene)pyrimidin-1-yl]-3,4-bis(oxidanyl)oxolan-2-yl]methoxy-oxidanyl-phosphoryl]oxy-oxidanyl-phosphoryl]oxy-6-(hydroxymethyl)-5-oxidanyl-3-[[(3R)-3-oxidanyltetradecanoyl]amino]oxan-4-yl] (3R)-3-oxidanyltetradecanoate ; # loop_ _pdbx_chem_comp_audit.comp_id _pdbx_chem_comp_audit.action_type _pdbx_chem_comp_audit.date _pdbx_chem_comp_audit.processing_site UDG "Create component" 2012-08-08 RCSB UDG "Initial release" 2012-09-28 RCSB #