data_ELE # _chem_comp.id ELE _chem_comp.name "2-keto 3 deoxy 6 phospho gluconate" _chem_comp.type NON-POLYMER _chem_comp.pdbx_type HETAIN _chem_comp.formula "C6 H11 O9 P" _chem_comp.mon_nstd_parent_comp_id ? _chem_comp.pdbx_synonyms ? _chem_comp.pdbx_formal_charge 0 _chem_comp.pdbx_initial_date 2018-03-26 _chem_comp.pdbx_modified_date 2018-06-22 _chem_comp.pdbx_ambiguous_flag N _chem_comp.pdbx_release_status REL _chem_comp.pdbx_replaced_by ? _chem_comp.pdbx_replaces ? _chem_comp.formula_weight 258.120 _chem_comp.one_letter_code ? _chem_comp.three_letter_code ELE _chem_comp.pdbx_model_coordinates_details ? _chem_comp.pdbx_model_coordinates_missing_flag N _chem_comp.pdbx_ideal_coordinates_details Corina _chem_comp.pdbx_ideal_coordinates_missing_flag N _chem_comp.pdbx_model_coordinates_db_code 6G3Z _chem_comp.pdbx_subcomponent_list ? _chem_comp.pdbx_processing_site EBI # loop_ _chem_comp_atom.comp_id _chem_comp_atom.atom_id _chem_comp_atom.alt_atom_id _chem_comp_atom.type_symbol _chem_comp_atom.charge _chem_comp_atom.pdbx_align _chem_comp_atom.pdbx_aromatic_flag _chem_comp_atom.pdbx_leaving_atom_flag _chem_comp_atom.pdbx_stereo_config _chem_comp_atom.model_Cartn_x _chem_comp_atom.model_Cartn_y _chem_comp_atom.model_Cartn_z _chem_comp_atom.pdbx_model_Cartn_x_ideal _chem_comp_atom.pdbx_model_Cartn_y_ideal _chem_comp_atom.pdbx_model_Cartn_z_ideal _chem_comp_atom.pdbx_component_atom_id _chem_comp_atom.pdbx_component_comp_id _chem_comp_atom.pdbx_ordinal ELE C4 C1 C 0 1 N N S -43.050 15.734 -13.388 -1.144 0.308 0.087 C4 ELE 1 ELE C5 C2 C 0 1 N N R -41.875 16.579 -13.836 0.097 -0.537 -0.208 C5 ELE 2 ELE C6 C3 C 0 1 N N N -42.288 17.711 -14.766 1.354 0.266 0.133 C6 ELE 3 ELE C3 C4 C 0 1 N N N -42.542 14.533 -12.609 -2.400 -0.495 -0.254 C3 ELE 4 ELE C1 C5 C 0 1 N N N -41.879 12.891 -14.550 -4.981 -0.281 -0.077 C1 ELE 5 ELE C2 C6 C 0 1 N N N -42.770 13.288 -13.452 -3.622 0.288 0.151 C2 ELE 6 ELE O11 O1 O 0 1 N N N -42.160 11.864 -15.193 -5.103 -1.373 -0.588 O11 ELE 7 ELE O12 O2 O 0 1 N N N -40.853 13.553 -14.820 -6.073 0.419 0.285 O12 ELE 8 ELE O1P O3 O 0 1 N N N -41.780 20.404 -15.573 5.057 -0.963 -0.702 O1P ELE 9 ELE O2P O4 O 0 1 N N N -39.691 19.692 -16.694 4.318 0.202 1.536 O2P ELE 10 ELE O3P O5 O 0 1 N N N -41.881 19.205 -17.764 4.153 1.393 -0.683 O3P ELE 11 ELE O4 O6 O 0 1 N N N -43.782 15.288 -14.532 -1.109 1.498 -0.704 O4 ELE 12 ELE O5 O7 O 0 1 N N N -41.264 17.124 -12.657 0.063 -1.727 0.582 O5 ELE 13 ELE O6 O8 O 0 1 N N N -41.210 17.954 -15.667 2.513 -0.476 -0.251 O6 ELE 14 ELE P P1 P 0 1 N N N -41.142 19.352 -16.453 4.013 0.068 -0.039 P ELE 15 ELE H4 H1 H 0 1 N N N -43.697 16.337 -12.734 -1.159 0.574 1.144 H4 ELE 16 ELE H5 H2 H 0 1 N N N -41.157 15.934 -14.364 0.112 -0.803 -1.265 H5 ELE 17 ELE H62 H3 H 0 1 N N N -42.497 18.618 -14.180 1.336 1.215 -0.404 H62 ELE 18 ELE H61 H4 H 0 1 N N N -43.188 17.423 -15.329 1.383 0.457 1.206 H61 ELE 19 ELE H32 H5 H 0 1 N N N -43.091 14.446 -11.660 -2.430 -0.686 -1.327 H32 ELE 20 ELE H31 H6 H 0 1 N N N -41.468 14.651 -12.402 -2.382 -1.444 0.283 H31 ELE 21 ELE H3 H9 H 0 1 N N N -40.392 13.142 -15.542 -6.932 0.009 0.117 H3 ELE 22 ELE H6 H10 H 0 1 N N N -42.532 20.776 -16.018 5.983 -0.699 -0.612 H6 ELE 23 ELE H7 H11 H 0 1 N N N -39.529 19.747 -17.629 4.245 -0.631 2.023 H7 ELE 24 ELE HO4 H12 H 0 1 N N N -44.519 14.758 -14.250 -1.094 1.336 -1.657 HO4 ELE 25 ELE HO5 H13 H 0 1 N N N -41.007 16.417 -12.077 0.048 -1.565 1.536 HO5 ELE 26 ELE O2 O9 O 0 1 N Y N -43.767 12.540 -13.229 -3.501 1.377 0.660 O2 ELE 27 # loop_ _chem_comp_bond.comp_id _chem_comp_bond.atom_id_1 _chem_comp_bond.atom_id_2 _chem_comp_bond.value_order _chem_comp_bond.pdbx_aromatic_flag _chem_comp_bond.pdbx_stereo_config _chem_comp_bond.pdbx_ordinal ELE O3P P DOUB N N 1 ELE O2P P SING N N 2 ELE P O6 SING N N 3 ELE P O1P SING N N 4 ELE O6 C6 SING N N 5 ELE O11 C1 DOUB N N 6 ELE O12 C1 SING N N 7 ELE C6 C5 SING N N 8 ELE C1 C2 SING N N 9 ELE O4 C4 SING N N 10 ELE C5 C4 SING N N 11 ELE C5 O5 SING N N 12 ELE C2 C3 SING N N 13 ELE C4 C3 SING N N 14 ELE C4 H4 SING N N 15 ELE C5 H5 SING N N 16 ELE C6 H62 SING N N 17 ELE C6 H61 SING N N 18 ELE C3 H32 SING N N 19 ELE C3 H31 SING N N 20 ELE O12 H3 SING N N 21 ELE O1P H6 SING N N 22 ELE O2P H7 SING N N 23 ELE O4 HO4 SING N N 24 ELE O5 HO5 SING N N 25 ELE C2 O2 DOUB N N 26 # loop_ _pdbx_chem_comp_descriptor.comp_id _pdbx_chem_comp_descriptor.type _pdbx_chem_comp_descriptor.program _pdbx_chem_comp_descriptor.program_version _pdbx_chem_comp_descriptor.descriptor ELE InChI InChI 1.03 "InChI=1S/C6H11O9P/c7-3(1-4(8)6(10)11)5(9)2-15-16(12,13)14/h3,5,7,9H,1-2H2,(H,10,11)(H2,12,13,14)/t3-,5+/m0/s1" ELE InChIKey InChI 1.03 OVPRPPOVAXRCED-WVZVXSGGSA-N ELE SMILES_CANONICAL CACTVS 3.385 "O[C@H](CO[P](O)(O)=O)[C@@H](O)CC(=O)C(O)=O" ELE SMILES CACTVS 3.385 "O[CH](CO[P](O)(O)=O)[CH](O)CC(=O)C(O)=O" ELE SMILES_CANONICAL "OpenEye OEToolkits" 2.0.6 "C([C@@H]([C@@H](COP(=O)(O)O)O)O)C(=O)C(=O)O" ELE SMILES "OpenEye OEToolkits" 2.0.6 "C(C(C(COP(=O)(O)O)O)O)C(=O)C(=O)O" # loop_ _pdbx_chem_comp_identifier.comp_id _pdbx_chem_comp_identifier.type _pdbx_chem_comp_identifier.program _pdbx_chem_comp_identifier.program_version _pdbx_chem_comp_identifier.identifier ELE "SYSTEMATIC NAME" "OpenEye OEToolkits" 2.0.6 "(4~{S},5~{R})-4,5-bis(oxidanyl)-2-oxidanylidene-6-phosphonooxy-hexanoic acid" # loop_ _pdbx_chem_comp_audit.comp_id _pdbx_chem_comp_audit.action_type _pdbx_chem_comp_audit.date _pdbx_chem_comp_audit.processing_site ELE "Create component" 2018-03-26 EBI ELE "Other modification" 2018-04-11 EBI ELE "Initial release" 2018-06-27 RCSB #