data_DI # _chem_comp.id DI _chem_comp.name "2'-DEOXYINOSINE-5'-MONOPHOSPHATE" _chem_comp.type "DNA LINKING" _chem_comp.pdbx_type ATOMN _chem_comp.formula "C10 H13 N4 O7 P" _chem_comp.mon_nstd_parent_comp_id ? _chem_comp.pdbx_synonyms ? _chem_comp.pdbx_formal_charge 0 _chem_comp.pdbx_initial_date 2001-06-01 _chem_comp.pdbx_modified_date 2011-06-04 _chem_comp.pdbx_ambiguous_flag N _chem_comp.pdbx_release_status REL _chem_comp.pdbx_replaced_by ? _chem_comp.pdbx_replaces OIP _chem_comp.formula_weight 332.207 _chem_comp.one_letter_code I _chem_comp.three_letter_code DI _chem_comp.pdbx_model_coordinates_details ? _chem_comp.pdbx_model_coordinates_missing_flag Y _chem_comp.pdbx_ideal_coordinates_details ? _chem_comp.pdbx_ideal_coordinates_missing_flag N _chem_comp.pdbx_model_coordinates_db_code ? _chem_comp.pdbx_subcomponent_list ? _chem_comp.pdbx_processing_site RCSB # loop_ _chem_comp_atom.comp_id _chem_comp_atom.atom_id _chem_comp_atom.alt_atom_id _chem_comp_atom.type_symbol _chem_comp_atom.charge _chem_comp_atom.pdbx_align _chem_comp_atom.pdbx_aromatic_flag _chem_comp_atom.pdbx_leaving_atom_flag _chem_comp_atom.pdbx_stereo_config _chem_comp_atom.model_Cartn_x _chem_comp_atom.model_Cartn_y _chem_comp_atom.model_Cartn_z _chem_comp_atom.pdbx_model_Cartn_x_ideal _chem_comp_atom.pdbx_model_Cartn_y_ideal _chem_comp_atom.pdbx_model_Cartn_z_ideal _chem_comp_atom.pdbx_component_atom_id _chem_comp_atom.pdbx_component_comp_id _chem_comp_atom.pdbx_ordinal DI OP3 O3P O 0 1 N Y N ? ? ? 0.339 -0.227 -4.868 OP3 DI 1 DI P P P 0 1 N N N 61.863 1.854 4.986 1.592 -1.245 -4.964 P DI 2 DI OP1 O1P O 0 1 N N N 62.553 1.821 3.701 2.575 -0.951 -6.059 OP1 DI 3 DI OP2 O2P O 0 1 N N N 61.488 3.190 5.614 0.886 -2.697 -5.051 OP2 DI 4 DI "O5'" O5* O 0 1 N N N 62.730 1.116 6.017 2.211 -1.232 -3.468 "O5'" DI 5 DI "C5'" C5* C 0 1 N N N 62.869 -0.279 5.966 1.348 -1.500 -2.377 "C5'" DI 6 DI "C4'" C4* C 0 1 N N R 64.276 -0.596 6.398 2.156 -1.432 -1.088 "C4'" DI 7 DI "O4'" O4* O 0 1 N N N 64.509 -2.015 6.640 2.678 -0.093 -0.958 "O4'" DI 8 DI "C3'" C3* C 0 1 N N S 65.465 -0.054 5.595 1.309 -1.697 0.152 "C3'" DI 9 DI "O3'" O3* O 0 1 N N N 66.497 0.204 6.513 2.127 -2.250 1.180 "O3'" DI 10 DI "C2'" C2* C 0 1 N N N 65.793 -1.280 4.755 0.878 -0.312 0.578 "C2'" DI 11 DI "C1'" C1* C 0 1 N N R 65.589 -2.419 5.757 2.101 0.516 0.211 "C1'" DI 12 DI N9 N9 N 0 1 Y N N 65.144 -3.696 5.266 1.818 1.923 -0.049 N9 DI 13 DI C8 C8 C 0 1 Y N N 65.733 -4.905 5.635 1.431 2.464 -1.253 C8 DI 14 DI N7 N7 N 0 1 Y N N 65.106 -5.938 5.081 1.248 3.768 -1.186 N7 DI 15 DI C5 C5 C 0 1 Y N N 64.065 -5.367 4.341 1.530 4.073 0.114 C5 DI 16 DI C6 C6 C 0 1 N N N 63.073 -6.003 3.576 1.498 5.359 0.762 C6 DI 17 DI O6 O6 O 0 1 N N N 62.956 -7.253 3.442 1.196 6.400 0.193 O6 DI 18 DI N1 N1 N 0 1 N N N 62.195 -5.116 2.969 1.856 5.247 2.113 N1 DI 19 DI C2 C2 C 0 1 N N N 62.250 -3.698 3.091 2.196 4.035 2.726 C2 DI 20 DI N3 N3 N 0 1 N N N 63.228 -3.090 3.861 2.227 2.870 2.145 N3 DI 21 DI C4 C4 C 0 1 Y N N 64.072 -3.969 4.431 1.883 2.958 0.840 C4 DI 22 DI HOP3 3HOP H 0 0 N N N -0.449 0.022 0.837 -0.163 -0.014 -5.684 HOP3 DI 23 DI HOP2 2HOP H 0 0 N N N 60.548 3.226 5.745 0.508 -2.990 -5.907 HOP2 DI 24 DI "H5'" 1H5* H 0 1 N N N 62.677 -0.655 4.950 0.551 -0.756 -2.359 "H5'" DI 25 DI "H5''" 2H5* H 0 0 N N N 62.145 -0.760 6.640 0.917 -2.495 -2.497 "H5''" DI 26 DI "H4'" H4* H 0 1 N N N 64.275 -0.006 7.327 3.008 -2.117 -1.157 "H4'" DI 27 DI "H3'" H3* H 0 1 N N N 65.301 0.862 5.008 0.475 -2.383 -0.018 "H3'" DI 28 DI "HO3'" H3T H 0 0 N Y N 67.325 0.262 6.051 2.928 -1.706 1.218 "HO3'" DI 29 DI "H2'" 1H2* H 0 1 N N N 66.801 -1.256 4.316 0.008 0.008 -0.009 "H2'" DI 30 DI "H2''" 2H2* H 0 0 N N N 65.128 -1.373 3.884 0.635 -0.225 1.641 "H2''" DI 31 DI "H1'" H1* H 0 1 N N N 66.593 -2.566 6.181 2.853 0.503 1.007 "H1'" DI 32 DI H8 H8 H 0 1 N N N 66.589 -4.991 6.288 1.301 1.856 -2.138 H8 DI 33 DI H1 H1 H 0 1 N N N 61.467 -5.502 2.402 1.869 6.091 2.678 H1 DI 34 DI H2 H2 H 0 1 N N N 61.521 -3.090 2.577 2.448 4.153 3.791 H2 DI 35 # 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