data_D24 # _chem_comp.id D24 _chem_comp.name "2,5-BIS-[4-[CYCLOPENTA-1,3-DIEN-5-YLAMINO-1-AMINOMETHYL]-PHEN-1-YL]FURAN" _chem_comp.type NON-POLYMER _chem_comp.pdbx_type HETAIN _chem_comp.formula "C28 H28 N4 O" _chem_comp.mon_nstd_parent_comp_id ? _chem_comp.pdbx_synonyms ? _chem_comp.pdbx_formal_charge 0 _chem_comp.pdbx_initial_date 2000-02-03 _chem_comp.pdbx_modified_date 2011-06-04 _chem_comp.pdbx_ambiguous_flag N _chem_comp.pdbx_release_status REL _chem_comp.pdbx_replaced_by ? _chem_comp.pdbx_replaces ? _chem_comp.formula_weight 436.548 _chem_comp.one_letter_code ? _chem_comp.three_letter_code D24 _chem_comp.pdbx_model_coordinates_details ? _chem_comp.pdbx_model_coordinates_missing_flag N _chem_comp.pdbx_ideal_coordinates_details ? _chem_comp.pdbx_ideal_coordinates_missing_flag N _chem_comp.pdbx_model_coordinates_db_code 1EEL _chem_comp.pdbx_subcomponent_list ? _chem_comp.pdbx_processing_site RCSB # loop_ _chem_comp_atom.comp_id _chem_comp_atom.atom_id _chem_comp_atom.alt_atom_id _chem_comp_atom.type_symbol _chem_comp_atom.charge _chem_comp_atom.pdbx_align _chem_comp_atom.pdbx_aromatic_flag _chem_comp_atom.pdbx_leaving_atom_flag _chem_comp_atom.pdbx_stereo_config _chem_comp_atom.model_Cartn_x _chem_comp_atom.model_Cartn_y _chem_comp_atom.model_Cartn_z _chem_comp_atom.pdbx_model_Cartn_x_ideal _chem_comp_atom.pdbx_model_Cartn_y_ideal _chem_comp_atom.pdbx_model_Cartn_z_ideal _chem_comp_atom.pdbx_component_atom_id _chem_comp_atom.pdbx_component_comp_id _chem_comp_atom.pdbx_ordinal D24 C7 C7 C 0 1 N N R 9.575 19.350 14.155 -0.611 0.459 6.665 C7 D24 1 D24 N2 N2 N 0 1 N N N 8.834 18.401 14.600 0.588 -0.295 7.051 N2 D24 2 D24 N1 N1 N 0 1 N N N 10.752 19.512 14.608 -0.419 1.881 6.984 N1 D24 3 D24 C8 C8 C 0 1 N N N 8.144 18.291 15.699 0.559 -0.413 8.515 C8 D24 4 D24 C9 C9 C 0 1 N N N 8.796 18.569 17.003 1.239 -1.691 8.952 C9 D24 5 D24 C10 C10 C 0 1 N N N 8.679 17.298 17.804 2.268 -1.338 9.713 C10 D24 6 D24 C11 C11 C 0 1 N N N 8.149 16.242 16.941 2.345 0.119 9.833 C11 D24 7 D24 C12 C12 C 0 1 N N N 8.035 16.785 15.577 1.365 0.697 9.149 C12 D24 8 D24 C1 C1 C 0 1 Y N N 8.174 21.823 10.997 -1.281 0.017 2.465 C1 D24 9 D24 C2 C2 C 0 1 Y N N 7.275 21.399 11.986 -0.043 0.460 2.935 C2 D24 10 D24 C3 C3 C 0 1 Y N N 7.732 20.567 13.052 0.165 0.601 4.291 C3 D24 11 D24 C4 C4 C 0 1 Y N N 9.078 20.187 13.097 -0.847 0.304 5.185 C4 D24 12 D24 C5 C5 C 0 1 Y N N 9.973 20.601 12.122 -2.075 -0.140 4.726 C5 D24 13 D24 C6 C6 C 0 1 Y N N 9.518 21.424 11.063 -2.299 -0.280 3.373 C6 D24 14 D24 CA CA C 0 1 Y N N 7.783 22.671 9.920 -1.513 -0.135 1.014 CA D24 15 D24 O1 O1 O 0 1 Y N N 8.784 23.024 9.014 -0.616 0.118 0.042 O1 D24 16 D24 CB CB C 0 1 Y N N 6.569 23.238 9.587 -2.668 -0.561 0.432 CB D24 17 D24 "CB'" "CB'" C 0 1 Y N N 6.811 23.989 8.393 -2.454 -0.554 -0.954 "CB'" D24 18 D24 "CA'" "CA'" C 0 1 Y N N 8.137 23.795 8.094 -1.175 -0.132 -1.157 "CA'" D24 19 D24 "C1'" "C1'" C 0 1 Y N N 8.945 24.212 7.009 -0.514 0.024 -2.468 "C1'" D24 20 D24 "C2'" "C2'" C 0 1 Y N N 8.397 24.982 5.963 0.807 0.468 -2.538 "C2'" D24 21 D24 "C3'" "C3'" C 0 1 Y N N 9.192 25.360 4.878 1.419 0.612 -3.766 "C3'" D24 22 D24 "C4'" "C4'" C 0 1 Y N N 10.543 24.946 4.849 0.725 0.318 -4.927 "C4'" D24 23 D24 "C5'" "C5'" C 0 1 Y N N 11.052 24.181 5.905 -0.585 -0.121 -4.865 "C5'" D24 24 D24 "C6'" "C6'" C 0 1 Y N N 10.263 23.807 6.991 -1.207 -0.275 -3.643 "C6'" D24 25 D24 "C7'" "C7'" C 0 1 N N S 11.468 25.281 3.707 1.399 0.477 -6.265 "C7'" D24 26 D24 "N2'" "N2'" N 0 1 N N N 11.600 26.491 3.102 0.839 -0.492 -7.215 "N2'" D24 27 D24 "N1'" "N1'" N 0 1 N N N 12.193 24.276 3.202 2.842 0.241 -6.118 "N1'" D24 28 D24 "C8'" "C8'" C 0 1 N N N 12.598 26.744 2.230 0.932 0.119 -8.547 "C8'" D24 29 D24 "C9'" "C9'" C 0 1 N N N 13.426 27.939 2.576 1.095 -0.949 -9.605 "C9'" D24 30 D24 CAX "C10'" C 0 1 N N N 13.410 28.995 1.507 0.048 -0.850 -10.415 CAX D24 31 D24 CBX "C11'" C 0 1 N N N 12.270 28.650 0.585 -0.840 0.230 -9.982 CBX D24 32 D24 CCX "C12'" C 0 1 N N N 11.936 27.203 0.935 -0.361 0.822 -8.894 CCX D24 33 D24 H7 H7 H 0 1 N N N 9.507 20.095 14.981 -1.472 0.077 7.213 H7 D24 34 D24 HN2 HN2 H 0 1 N N N 9.436 17.578 14.590 0.475 -1.227 6.683 HN2 D24 35 D24 H11A 1H1 H 0 0 N N N 11.340 20.266 14.254 0.384 2.190 6.457 H11A D24 36 D24 H12A 2H1 H 0 0 N N N 11.259 18.633 14.503 -1.217 2.372 6.610 H12A D24 37 D24 H8 H8 H 0 1 N N N 7.276 18.989 15.743 -0.469 -0.390 8.876 H8 D24 38 D24 H9 H9 H 0 1 N N N 9.267 19.517 17.311 0.945 -2.698 8.695 H9 D24 39 D24 H10 H10 H 0 1 N N N 8.942 17.160 18.866 2.954 -2.030 10.179 H10 D24 40 D24 H11 H11 H 0 1 N N N 7.883 15.220 17.261 3.095 0.651 10.400 H11 D24 41 D24 H12 H12 H 0 1 N N N 7.897 16.189 14.658 1.180 1.758 9.061 H12 D24 42 D24 H2 H2 H 0 1 N N N 6.220 21.716 11.926 0.748 0.693 2.238 H2 D24 43 D24 H3 H3 H 0 1 N N N 7.045 20.217 13.841 1.122 0.944 4.655 H3 D24 44 D24 H5 H5 H 0 1 N N N 11.026 20.281 12.187 -2.861 -0.370 5.430 H5 D24 45 D24 H6 H6 H 0 1 N N N 10.219 21.758 10.279 -3.259 -0.623 3.016 H6 D24 46 D24 HB HB H 0 1 N N N 5.625 23.118 10.145 -3.577 -0.845 0.941 HB D24 47 D24 "HB'" "HB'" H 0 1 N N N 6.105 24.604 7.810 -3.167 -0.834 -1.716 "HB'" D24 48 D24 "H2'" "H2'" H 0 1 N N N 7.338 25.290 5.993 1.350 0.698 -1.633 "H2'" D24 49 D24 "H3'" "H3'" H 0 1 N N N 8.763 25.969 4.064 2.441 0.955 -3.822 "H3'" D24 50 D24 "H5'" "H5'" H 0 1 N N N 12.107 23.862 5.880 -1.121 -0.348 -5.774 "H5'" D24 51 D24 "H6'" "H6'" H 0 1 N N N 10.672 23.203 7.818 -2.229 -0.618 -3.596 "H6'" D24 52 D24 "H7'" "H7'" H 0 1 N N N 11.208 26.135 4.374 1.233 1.488 -6.637 "H7'" D24 53 D24 "HN2'" "HN2'" H 0 0 N N N 11.635 27.202 3.831 1.459 -1.288 -7.217 "HN2'" D24 54 D24 "H1'1" "1H1'" H 0 0 N N N 12.818 24.502 2.429 2.947 -0.701 -5.773 "H1'1" D24 55 D24 "H1'2" "2H1'" H 0 0 N N N 11.574 23.513 2.927 3.234 0.255 -7.047 "H1'2" D24 56 D24 "H8'" "H8'" H 0 1 N N N 13.223 25.821 2.201 1.767 0.819 -8.584 "H8'" D24 57 D24 "H9'" "H9'" H 0 1 N N N 13.989 28.031 3.519 1.907 -1.656 -9.686 "H9'" D24 58 D24 "H10'" "H10'" H 0 0 N N N 14.097 29.852 1.417 -0.124 -1.480 -11.275 "H10'" D24 59 D24 "H11'" "H11'" H 0 0 N N N 11.793 29.301 -0.166 -1.758 0.507 -10.478 "H11'" D24 60 D24 "H12'" "H12'" H 0 0 N N N 11.286 26.558 0.318 -0.808 1.647 -8.360 "H12'" D24 61 # loop_ _chem_comp_bond.comp_id _chem_comp_bond.atom_id_1 _chem_comp_bond.atom_id_2 _chem_comp_bond.value_order _chem_comp_bond.pdbx_aromatic_flag _chem_comp_bond.pdbx_stereo_config _chem_comp_bond.pdbx_ordinal D24 C7 N2 SING N N 1 D24 C7 N1 SING N N 2 D24 C7 C4 SING N N 3 D24 C7 H7 SING N N 4 D24 N2 C8 SING N N 5 D24 N2 HN2 SING N N 6 D24 N1 H11A SING N N 7 D24 N1 H12A SING N N 8 D24 C8 C9 SING N N 9 D24 C8 C12 SING N N 10 D24 C8 H8 SING N N 11 D24 C9 C10 DOUB N N 12 D24 C9 H9 SING N N 13 D24 C10 C11 SING N N 14 D24 C10 H10 SING N N 15 D24 C11 C12 DOUB N N 16 D24 C11 H11 SING N N 17 D24 C12 H12 SING N N 18 D24 C1 C2 DOUB Y N 19 D24 C1 C6 SING Y N 20 D24 C1 CA SING Y N 21 D24 C2 C3 SING Y N 22 D24 C2 H2 SING N N 23 D24 C3 C4 DOUB Y N 24 D24 C3 H3 SING N N 25 D24 C4 C5 SING Y N 26 D24 C5 C6 DOUB Y N 27 D24 C5 H5 SING N N 28 D24 C6 H6 SING N N 29 D24 CA O1 SING Y N 30 D24 CA CB DOUB Y N 31 D24 O1 "CA'" SING Y N 32 D24 CB "CB'" SING Y N 33 D24 CB HB SING N N 34 D24 "CB'" "CA'" DOUB Y N 35 D24 "CB'" "HB'" SING N N 36 D24 "CA'" "C1'" SING Y N 37 D24 "C1'" "C2'" DOUB Y N 38 D24 "C1'" "C6'" SING Y N 39 D24 "C2'" "C3'" SING Y N 40 D24 "C2'" "H2'" SING N N 41 D24 "C3'" "C4'" DOUB Y N 42 D24 "C3'" "H3'" SING N N 43 D24 "C4'" "C5'" SING Y N 44 D24 "C4'" "C7'" SING N N 45 D24 "C5'" "C6'" DOUB Y N 46 D24 "C5'" "H5'" SING N N 47 D24 "C6'" "H6'" SING N N 48 D24 "C7'" "N2'" SING N N 49 D24 "C7'" "N1'" SING N N 50 D24 "C7'" "H7'" SING N N 51 D24 "N2'" "C8'" SING N N 52 D24 "N2'" "HN2'" SING N N 53 D24 "N1'" "H1'1" SING N N 54 D24 "N1'" "H1'2" SING N N 55 D24 "C8'" "C9'" SING N N 56 D24 "C8'" CCX SING N N 57 D24 "C8'" "H8'" SING N N 58 D24 "C9'" CAX DOUB N N 59 D24 "C9'" "H9'" SING N N 60 D24 CAX CBX SING N N 61 D24 CAX "H10'" SING N N 62 D24 CBX CCX DOUB N N 63 D24 CBX "H11'" SING N N 64 D24 CCX "H12'" SING N N 65 # loop_ _pdbx_chem_comp_descriptor.comp_id _pdbx_chem_comp_descriptor.type _pdbx_chem_comp_descriptor.program _pdbx_chem_comp_descriptor.program_version _pdbx_chem_comp_descriptor.descriptor D24 SMILES ACDLabs 10.04 "o1c(ccc1c2ccc(cc2)C(N)NC3C=CC=C3)c4ccc(cc4)C(N)NC5C=CC=C5" D24 SMILES_CANONICAL CACTVS 3.341 "N[C@H](NC1C=CC=C1)c2ccc(cc2)c3oc(cc3)c4ccc(cc4)[C@@H](N)NC5C=CC=C5" D24 SMILES CACTVS 3.341 "N[CH](NC1C=CC=C1)c2ccc(cc2)c3oc(cc3)c4ccc(cc4)[CH](N)NC5C=CC=C5" D24 SMILES_CANONICAL "OpenEye OEToolkits" 1.5.0 "c1cc(ccc1c2ccc(o2)c3ccc(cc3)C(N)NC4C=CC=C4)C(N)NC5C=CC=C5" D24 SMILES "OpenEye OEToolkits" 1.5.0 "c1cc(ccc1c2ccc(o2)c3ccc(cc3)C(N)NC4C=CC=C4)C(N)NC5C=CC=C5" D24 InChI InChI 1.03 "InChI=1S/C28H28N4O/c29-27(31-23-5-1-2-6-23)21-13-9-19(10-14-21)25-17-18-26(33-25)20-11-15-22(16-12-20)28(30)32-24-7-3-4-8-24/h1-18,23-24,27-28,31-32H,29-30H2/t27-,28+" D24 InChIKey InChI 1.03 IKWANHYVTLMFON-HNRBIFIRSA-N # loop_ _pdbx_chem_comp_identifier.comp_id _pdbx_chem_comp_identifier.type _pdbx_chem_comp_identifier.program _pdbx_chem_comp_identifier.program_version _pdbx_chem_comp_identifier.identifier D24 "SYSTEMATIC NAME" ACDLabs 10.04 "(R,S)-(furan-2,5-diyldibenzene-4,1-diyl)bis(N-cyclopenta-2,4-dien-1-ylmethanediamine)" D24 "SYSTEMATIC NAME" "OpenEye OEToolkits" 1.5.0 "1-[4-[5-[4-[amino-(1-cyclopenta-2,4-dienylamino)methyl]phenyl]furan-2-yl]phenyl]-N-(1-cyclopenta-2,4-dienyl)methanediamine" # loop_ _pdbx_chem_comp_audit.comp_id _pdbx_chem_comp_audit.action_type _pdbx_chem_comp_audit.date _pdbx_chem_comp_audit.processing_site D24 "Create component" 2000-02-03 RCSB D24 "Modify aromatic_flag" 2011-06-04 RCSB D24 "Modify descriptor" 2011-06-04 RCSB #