data_D21 # _chem_comp.id D21 _chem_comp.name "(2R)-1-(hexadecanoyloxy)-3-(phosphonooxy)propan-2-yl (9Z)-octadec-9-enoate" _chem_comp.type NON-POLYMER _chem_comp.pdbx_type HETAIN _chem_comp.formula "C37 H71 O8 P" _chem_comp.mon_nstd_parent_comp_id ? _chem_comp.pdbx_synonyms ? _chem_comp.pdbx_formal_charge 0 _chem_comp.pdbx_initial_date 2017-10-16 _chem_comp.pdbx_modified_date 2017-10-27 _chem_comp.pdbx_ambiguous_flag N _chem_comp.pdbx_release_status REL _chem_comp.pdbx_replaced_by ? _chem_comp.pdbx_replaces ? _chem_comp.formula_weight 674.929 _chem_comp.one_letter_code ? _chem_comp.three_letter_code D21 _chem_comp.pdbx_model_coordinates_details ? _chem_comp.pdbx_model_coordinates_missing_flag N _chem_comp.pdbx_ideal_coordinates_details Corina _chem_comp.pdbx_ideal_coordinates_missing_flag N _chem_comp.pdbx_model_coordinates_db_code 5WKG _chem_comp.pdbx_subcomponent_list ? _chem_comp.pdbx_processing_site RCSB # loop_ _chem_comp_atom.comp_id _chem_comp_atom.atom_id _chem_comp_atom.alt_atom_id _chem_comp_atom.type_symbol _chem_comp_atom.charge _chem_comp_atom.pdbx_align _chem_comp_atom.pdbx_aromatic_flag _chem_comp_atom.pdbx_leaving_atom_flag _chem_comp_atom.pdbx_stereo_config _chem_comp_atom.model_Cartn_x _chem_comp_atom.model_Cartn_y _chem_comp_atom.model_Cartn_z _chem_comp_atom.pdbx_model_Cartn_x_ideal _chem_comp_atom.pdbx_model_Cartn_y_ideal _chem_comp_atom.pdbx_model_Cartn_z_ideal _chem_comp_atom.pdbx_component_atom_id _chem_comp_atom.pdbx_component_comp_id _chem_comp_atom.pdbx_ordinal D21 C01 C1 C 0 1 N N N 2.741 28.736 5.267 18.893 6.777 -1.154 C01 D21 1 D21 C02 C2 C 0 1 N N N 2.146 27.498 4.605 17.973 6.058 -0.165 C02 D21 2 D21 C03 C3 C 0 1 N N N 2.332 27.384 3.094 16.735 5.543 -0.902 C03 D21 3 D21 C04 C4 C 0 1 N N N 2.273 25.969 2.499 15.815 4.825 0.087 C04 D21 4 D21 C05 C5 C 0 1 N N N 1.342 24.994 3.206 14.577 4.310 -0.650 C05 D21 5 D21 C06 C6 C 0 1 N N N 1.081 23.674 2.513 13.656 3.592 0.339 C06 D21 6 D21 C07 C7 C 0 1 N N N 0.012 22.895 3.250 12.418 3.076 -0.398 C07 D21 7 D21 C08 C8 C 0 1 N N N -0.556 21.702 2.516 11.498 2.358 0.591 C08 D21 8 D21 C09 C9 C 0 1 N N N -1.614 22.007 1.457 10.260 1.843 -0.146 C09 D21 9 D21 C10 C10 C 0 1 N N N -3.029 22.202 1.976 9.340 1.125 0.843 C10 D21 10 D21 C11 C11 C 0 1 N N N -4.125 21.984 0.926 8.102 0.610 0.106 C11 D21 11 D21 C12 C12 C 0 1 N N N -5.558 22.174 1.433 7.182 -0.109 1.095 C12 D21 12 D21 C13 C13 C 0 1 N N N -6.001 21.197 2.526 5.944 -0.624 0.357 C13 D21 13 D21 C14 C14 C 0 1 N N N -7.494 21.112 2.813 5.024 -1.342 1.347 C14 D21 14 D21 C15 C15 C 0 1 N N N -8.046 22.331 3.536 3.786 -1.857 0.609 C15 D21 15 D21 C16 C16 C 0 1 N N N -8.798 22.017 4.798 2.879 -2.565 1.584 C16 D21 16 D21 O17 O1 O 0 1 N N N -9.988 21.834 4.860 3.191 -2.648 2.748 O17 D21 17 D21 O18 O2 O 0 1 N N N -7.978 22.019 5.858 1.725 -3.102 1.158 O18 D21 18 D21 C19 C17 C 0 1 N N N -8.544 22.201 7.178 0.902 -3.768 2.151 C19 D21 19 D21 C20 C18 C 0 1 N N R -7.588 21.687 8.226 -0.362 -4.313 1.484 C20 D21 20 D21 C21 C19 C 0 1 N N N -8.044 21.829 9.656 0.028 -5.214 0.311 C21 D21 21 D21 O22 O3 O 0 1 N N N -8.184 23.225 9.993 0.878 -4.493 -0.582 O22 D21 22 D21 P23 P1 P 0 1 N N N -9.177 23.899 11.047 1.482 -5.135 -1.930 P23 D21 23 D21 O24 O4 O 0 1 N N N -8.813 25.351 11.245 2.282 -4.005 -2.752 O24 D21 24 D21 O25 O5 O 0 1 N N N -9.072 23.071 12.330 2.487 -6.334 -1.550 O25 D21 25 D21 O26 O6 O 0 1 N N N -10.596 23.700 10.486 0.377 -5.662 -2.763 O26 D21 26 D21 O30 O7 O 0 1 N N N -6.139 21.787 7.981 -1.167 -3.207 0.997 O30 D21 27 D21 C31 C20 C 0 1 N N N -5.500 22.976 7.988 -2.496 -3.391 0.960 C31 D21 28 D21 O32 O8 O 0 1 N N N -6.044 24.036 8.150 -2.971 -4.440 1.323 O32 D21 29 D21 C33 C21 C 0 1 N N N -4.027 22.812 7.722 -3.396 -2.287 0.467 C33 D21 30 D21 C34 C22 C 0 1 N N N -3.341 21.637 8.426 -4.853 -2.751 0.527 C34 D21 31 D21 C35 C23 C 0 1 N N N -1.859 21.538 8.074 -5.766 -1.631 0.026 C35 D21 32 D21 C36 C24 C 0 1 N N N -1.072 20.456 8.798 -7.223 -2.095 0.086 C36 D21 33 D21 C37 C25 C 0 1 N N N 0.441 20.589 8.671 -8.137 -0.975 -0.415 C37 D21 34 D21 C38 C26 C 0 1 N N N 1.153 21.314 9.818 -9.593 -1.439 -0.354 C38 D21 35 D21 C39 C27 C 0 1 N N N 1.701 20.407 10.914 -10.507 -0.319 -0.855 C39 D21 36 D21 C40 C28 C 0 1 N N N 2.838 21.024 11.744 -11.941 -0.776 -0.796 C40 D21 37 D21 C41 C29 C 0 1 N N N 3.280 20.179 12.908 -12.838 -0.043 -0.183 C41 D21 38 D21 C42 C30 C 0 1 N N N 2.499 19.802 13.903 -12.474 1.333 0.313 C42 D21 39 D21 C43 C31 C 0 1 N N N 2.841 18.986 15.104 -13.471 2.354 -0.239 C43 D21 40 D21 C44 C32 C 0 1 N N N 2.010 19.471 16.301 -13.102 3.751 0.265 C44 D21 41 D21 C45 C33 C 0 1 N N N 1.960 18.536 17.506 -14.099 4.772 -0.287 C45 D21 42 D21 C46 C34 C 0 1 N N N 1.132 17.259 17.357 -13.730 6.169 0.217 C46 D21 43 D21 C47 C35 C 0 1 N N N 0.851 16.609 18.707 -14.727 7.190 -0.335 C47 D21 44 D21 C48 C36 C 0 1 N N N 0.015 15.350 18.674 -14.358 8.586 0.169 C48 D21 45 D21 C49 C37 C 0 1 N N N -0.471 14.897 20.043 -15.355 9.608 -0.383 C49 D21 46 D21 H1 H1 H 0 1 N N N 2.544 28.705 6.349 19.199 6.082 -1.936 H1 D21 47 D21 H2 H2 H 0 1 N N N 3.827 28.759 5.093 18.361 7.616 -1.601 H2 D21 48 D21 H3 H3 H 0 1 N N N 2.282 29.638 4.837 19.775 7.144 -0.629 H3 D21 49 D21 H4 H4 H 0 1 N N N 1.065 27.494 4.811 18.505 5.219 0.282 H4 D21 50 D21 H5 H5 H 0 1 N N N 2.610 26.615 5.068 17.667 6.753 0.617 H5 D21 51 D21 H6 H6 H 0 1 N N N 3.315 27.810 2.846 16.203 6.383 -1.349 H6 D21 52 D21 H7 H7 H 0 1 N N N 1.542 27.981 2.614 17.041 4.848 -1.684 H7 D21 53 D21 H8 H8 H 0 1 N N N 1.941 26.055 1.454 16.347 3.986 0.534 H8 D21 54 D21 H9 H9 H 0 1 N N N 1.779 24.772 4.191 14.045 5.149 -1.098 H9 D21 55 D21 H10 H10 H 0 1 N N N 0.745 23.865 1.483 14.188 2.752 0.786 H10 D21 56 D21 H11 H11 H 0 1 N N N 2.010 23.085 2.493 13.351 4.286 1.121 H11 D21 57 D21 H12 H12 H 0 1 N N N 0.447 22.535 4.194 11.887 3.916 -0.846 H12 D21 58 D21 H13 H13 H 0 1 N N N -0.818 23.584 3.468 12.724 2.382 -1.180 H13 D21 59 D21 H14 H14 H 0 1 N N N -1.010 21.033 3.262 12.030 1.519 1.038 H14 D21 60 D21 H15 H15 H 0 1 N N N 0.278 21.185 2.019 11.192 3.053 1.373 H15 D21 61 D21 H16 H16 H 0 1 N N N -1.628 21.170 0.743 9.728 2.683 -0.594 H16 D21 62 D21 H17 H17 H 0 1 N N N -1.315 22.929 0.936 10.566 1.148 -0.928 H17 D21 63 D21 H18 H18 H 0 1 N N N -3.117 23.230 2.357 9.872 0.285 1.290 H18 D21 64 D21 H19 H19 H 0 1 N N N -3.195 21.491 2.799 9.034 1.820 1.625 H19 D21 65 D21 H20 H20 H 0 1 N N N -4.032 20.956 0.545 7.570 1.449 -0.342 H20 D21 66 D21 H21 H21 H 0 1 N N N -3.957 22.696 0.105 8.408 -0.085 -0.677 H21 D21 67 D21 H22 H22 H 0 1 N N N -5.644 23.195 1.834 7.714 -0.948 1.542 H22 D21 68 D21 H23 H23 H 0 1 N N N -5.662 20.193 2.231 5.412 0.216 -0.090 H23 D21 69 D21 H24 H24 H 0 1 N N N -8.026 21.005 1.856 5.556 -2.181 1.794 H24 D21 70 D21 H25 H25 H 0 1 N N N -7.678 20.225 3.437 4.718 -0.647 2.129 H25 D21 71 D21 H26 H26 H 0 1 N N N -7.203 22.990 3.793 3.254 -1.018 0.162 H26 D21 72 D21 H27 H27 H 0 1 N N N -8.727 22.857 2.852 4.092 -2.552 -0.173 H27 D21 73 D21 H28 H28 H 0 1 N N N -8.731 23.271 7.349 1.462 -4.591 2.595 H28 D21 74 D21 H29 H29 H 0 1 N N N -9.492 21.647 7.247 0.625 -3.057 2.929 H29 D21 75 D21 H30 H30 H 0 1 N N N -7.730 20.604 8.092 -0.937 -4.889 2.209 H30 D21 76 D21 H31 H31 H 0 1 N N N -9.014 21.325 9.781 0.557 -6.091 0.687 H31 D21 77 D21 H32 H32 H 0 1 N N N -7.302 21.366 10.323 -0.870 -5.531 -0.219 H32 D21 78 D21 H33 H33 H 0 1 N N N -9.543 25.900 10.982 2.673 -4.322 -3.577 H33 D21 79 D21 H34 H34 H 0 1 N N N -9.896 22.626 12.489 3.236 -6.061 -1.003 H34 D21 80 D21 H35 H35 H 0 1 N N N -3.894 22.678 6.638 -3.269 -1.406 1.096 H35 D21 81 D21 H36 H36 H 0 1 N N N -3.523 23.736 8.042 -3.136 -2.039 -0.563 H36 D21 82 D21 H37 H37 H 0 1 N N N -3.438 21.770 9.514 -4.980 -3.632 -0.102 H37 D21 83 D21 H38 H38 H 0 1 N N N -3.840 20.704 8.125 -5.113 -2.999 1.556 H38 D21 84 D21 H39 H39 H 0 1 N N N -1.782 21.344 6.994 -5.640 -0.750 0.655 H39 D21 85 D21 H40 H40 H 0 1 N N N -1.392 22.506 8.307 -5.506 -1.383 -1.003 H40 D21 86 D21 H41 H41 H 0 1 N N N -1.333 20.497 9.866 -7.350 -2.976 -0.543 H41 D21 87 D21 H42 H42 H 0 1 N N N -1.368 19.480 8.385 -7.483 -2.343 1.116 H42 D21 88 D21 H43 H43 H 0 1 N N N 0.863 19.575 8.601 -8.010 -0.094 0.214 H43 D21 89 D21 H44 H44 H 0 1 N N N 0.653 21.139 7.743 -7.877 -0.727 -1.444 H44 D21 90 D21 H45 H45 H 0 1 N N N 1.994 21.881 9.393 -9.720 -2.320 -0.983 H45 D21 91 D21 H46 H46 H 0 1 N N N 0.436 22.010 10.278 -9.853 -1.687 0.675 H46 D21 92 D21 H47 H47 H 0 1 N N N 0.876 20.155 11.596 -10.380 0.562 -0.226 H47 D21 93 D21 H48 H48 H 0 1 N N N 2.080 19.488 10.442 -10.247 -0.071 -1.885 H48 D21 94 D21 H49 H49 H 0 1 N N N 3.281 21.981 11.512 -12.231 -1.708 -1.258 H49 D21 95 D21 H51 H51 H 0 1 N N N 4.311 19.858 12.931 -13.837 -0.424 -0.034 H51 D21 96 D21 H52 H52 H 0 1 N N N 2.105 20.743 14.314 -12.506 1.346 1.403 H52 D21 97 D21 H53 H53 H 0 1 N N N 2.616 17.928 14.905 -13.439 2.341 -1.328 H53 D21 98 D21 H54 H54 H 0 1 N N N 3.912 19.097 15.331 -14.476 2.100 0.099 H54 D21 99 D21 H55 H55 H 0 1 N N N 2.432 20.430 16.637 -13.134 3.764 1.355 H55 D21 100 D21 H56 H56 H 0 1 N N N 0.978 19.626 15.953 -12.097 4.005 -0.072 H56 D21 101 D21 H57 H57 H 0 1 N N N 2.993 18.237 17.738 -14.067 4.759 -1.376 H57 D21 102 D21 H58 H58 H 0 1 N N N 1.544 19.105 18.351 -15.104 4.518 0.051 H58 D21 103 D21 H59 H59 H 0 1 N N N 0.175 17.509 16.875 -13.762 6.182 1.307 H59 D21 104 D21 H60 H60 H 0 1 N N N 1.685 16.547 16.727 -12.725 6.423 -0.120 H60 D21 105 D21 H61 H61 H 0 1 N N N 1.818 16.359 19.168 -14.695 7.176 -1.424 H61 D21 106 D21 H62 H62 H 0 1 N N N 0.326 17.346 19.333 -15.732 6.936 0.002 H62 D21 107 D21 H63 H63 H 0 1 N N N -0.863 15.534 18.038 -14.390 8.600 1.258 H63 D21 108 D21 H64 H64 H 0 1 N N N 0.621 14.543 18.237 -13.353 8.841 -0.168 H64 D21 109 D21 H65 H65 H 0 1 N N N -1.069 13.980 19.935 -15.323 9.594 -1.472 H65 D21 110 D21 H66 H66 H 0 1 N N N 0.395 14.696 20.691 -16.360 9.353 -0.046 H66 D21 111 D21 H67 H67 H 0 1 N N N -1.090 15.688 20.492 -15.092 10.603 -0.024 H67 D21 112 D21 H68 H68 H 0 1 N N N 3.289 25.548 2.528 15.509 5.520 0.869 H68 D21 113 D21 H69 H69 H 0 1 N N N 0.373 25.497 3.340 14.882 3.615 -1.432 H69 D21 114 D21 H70 H70 H 0 1 N N N -6.239 22.058 0.577 6.876 0.586 1.877 H70 D21 115 D21 H71 H71 H 0 1 N N N -5.500 21.494 3.459 6.250 -1.319 -0.425 H71 D21 116 D21 H50 H50 H 0 1 N N N 1.685 19.245 13.416 -11.469 1.587 -0.024 H50 D21 117 # loop_ _chem_comp_bond.comp_id _chem_comp_bond.atom_id_1 _chem_comp_bond.atom_id_2 _chem_comp_bond.value_order _chem_comp_bond.pdbx_aromatic_flag _chem_comp_bond.pdbx_stereo_config _chem_comp_bond.pdbx_ordinal D21 C11 C12 SING N N 1 D21 C11 C10 SING N N 2 D21 C12 C13 SING N N 3 D21 C09 C10 SING N N 4 D21 C09 C08 SING N N 5 D21 C04 C03 SING N N 6 D21 C04 C05 SING N N 7 D21 C06 C05 SING N N 8 D21 C06 C07 SING N N 9 D21 C08 C07 SING N N 10 D21 C13 C14 SING N N 11 D21 C14 C15 SING N N 12 D21 C03 C02 SING N N 13 D21 C15 C16 SING N N 14 D21 C02 C01 SING N N 15 D21 C16 O17 DOUB N N 16 D21 C16 O18 SING N N 17 D21 O18 C19 SING N N 18 D21 C19 C20 SING N N 19 D21 C33 C31 SING N N 20 D21 C33 C34 SING N N 21 D21 O30 C31 SING N N 22 D21 O30 C20 SING N N 23 D21 C31 O32 DOUB N N 24 D21 C35 C34 SING N N 25 D21 C35 C36 SING N N 26 D21 C20 C21 SING N N 27 D21 C37 C36 SING N N 28 D21 C37 C38 SING N N 29 D21 C21 O22 SING N N 30 D21 C38 C39 SING N N 31 D21 O22 P23 SING N N 32 D21 O26 P23 DOUB N N 33 D21 C39 C40 SING N N 34 D21 P23 O24 SING N N 35 D21 P23 O25 SING N N 36 D21 C40 C41 DOUB N Z 37 D21 C41 C42 SING N N 38 D21 C42 C43 SING N N 39 D21 C43 C44 SING N N 40 D21 C44 C45 SING N N 41 D21 C46 C45 SING N N 42 D21 C46 C47 SING N N 43 D21 C48 C47 SING N N 44 D21 C48 C49 SING N N 45 D21 C01 H1 SING N N 46 D21 C01 H2 SING N N 47 D21 C01 H3 SING N N 48 D21 C02 H4 SING N N 49 D21 C02 H5 SING N N 50 D21 C03 H6 SING N N 51 D21 C03 H7 SING N N 52 D21 C04 H8 SING N N 53 D21 C05 H9 SING N N 54 D21 C06 H10 SING N N 55 D21 C06 H11 SING N N 56 D21 C07 H12 SING N N 57 D21 C07 H13 SING N N 58 D21 C08 H14 SING N N 59 D21 C08 H15 SING N N 60 D21 C09 H16 SING N N 61 D21 C09 H17 SING N N 62 D21 C10 H18 SING N N 63 D21 C10 H19 SING N N 64 D21 C11 H20 SING N N 65 D21 C11 H21 SING N N 66 D21 C12 H22 SING N N 67 D21 C13 H23 SING N N 68 D21 C14 H24 SING N N 69 D21 C14 H25 SING N N 70 D21 C15 H26 SING N N 71 D21 C15 H27 SING N N 72 D21 C19 H28 SING N N 73 D21 C19 H29 SING N N 74 D21 C20 H30 SING N N 75 D21 C21 H31 SING N N 76 D21 C21 H32 SING N N 77 D21 O24 H33 SING N N 78 D21 O25 H34 SING N N 79 D21 C33 H35 SING N N 80 D21 C33 H36 SING N N 81 D21 C34 H37 SING N N 82 D21 C34 H38 SING N N 83 D21 C35 H39 SING N N 84 D21 C35 H40 SING N N 85 D21 C36 H41 SING N N 86 D21 C36 H42 SING N N 87 D21 C37 H43 SING N N 88 D21 C37 H44 SING N N 89 D21 C38 H45 SING N N 90 D21 C38 H46 SING N N 91 D21 C39 H47 SING N N 92 D21 C39 H48 SING N N 93 D21 C40 H49 SING N N 94 D21 C41 H51 SING N N 95 D21 C42 H52 SING N N 96 D21 C43 H53 SING N N 97 D21 C43 H54 SING N N 98 D21 C44 H55 SING N N 99 D21 C44 H56 SING N N 100 D21 C45 H57 SING N N 101 D21 C45 H58 SING N N 102 D21 C46 H59 SING N N 103 D21 C46 H60 SING N N 104 D21 C47 H61 SING N N 105 D21 C47 H62 SING N N 106 D21 C48 H63 SING N N 107 D21 C48 H64 SING N N 108 D21 C49 H65 SING N N 109 D21 C49 H66 SING N N 110 D21 C49 H67 SING N N 111 D21 C04 H68 SING N N 112 D21 C05 H69 SING N N 113 D21 C12 H70 SING N N 114 D21 C13 H71 SING N N 115 D21 C42 H50 SING N N 116 # loop_ _pdbx_chem_comp_descriptor.comp_id _pdbx_chem_comp_descriptor.type _pdbx_chem_comp_descriptor.program _pdbx_chem_comp_descriptor.program_version _pdbx_chem_comp_descriptor.descriptor D21 SMILES ACDLabs 12.01 "CCCCCCCCCCCCCCCC(=O)OCC(COP(O)(O)=O)OC(=O)CCCCCCC\C=C/CCCCCCCC" D21 InChI InChI 1.03 "InChI=1S/C37H71O8P/c1-3-5-7-9-11-13-15-17-18-20-22-24-26-28-30-32-37(39)45-35(34-44-46(40,41)42)33-43-36(38)31-29-27-25-23-21-19-16-14-12-10-8-6-4-2/h17-18,35H,3-16,19-34H2,1-2H3,(H2,40,41,42)/t35-/m1/s1" D21 InChIKey InChI 1.03 OPVZUEPSMJNLOM-PGUFJCEWSA-N D21 SMILES_CANONICAL CACTVS 3.385 "CCCCCCCCCCCCCCCC(=O)OC[C@H](CO[P](O)(O)=O)OC(=O)CCCCCCC\C=C/CCCCCCCC" D21 SMILES CACTVS 3.385 "CCCCCCCCCCCCCCCC(=O)OC[CH](CO[P](O)(O)=O)OC(=O)CCCCCCCC=CCCCCCCCC" D21 SMILES_CANONICAL "OpenEye OEToolkits" 2.0.6 "CCCCCCCCCCCCCCCC(=O)OC[C@H](COP(=O)(O)O)OC(=O)CCCCCCCC=CCCCCCCCC" D21 SMILES "OpenEye OEToolkits" 2.0.6 "CCCCCCCCCCCCCCCC(=O)OCC(COP(=O)(O)O)OC(=O)CCCCCCCC=CCCCCCCCC" # loop_ _pdbx_chem_comp_identifier.comp_id _pdbx_chem_comp_identifier.type _pdbx_chem_comp_identifier.program _pdbx_chem_comp_identifier.program_version _pdbx_chem_comp_identifier.identifier D21 "SYSTEMATIC NAME" ACDLabs 12.01 "(2R)-1-(hexadecanoyloxy)-3-(phosphonooxy)propan-2-yl (9Z)-octadec-9-enoate" D21 "SYSTEMATIC NAME" "OpenEye OEToolkits" 2.0.6 "[(2~{R})-1-hexadecanoyloxy-3-phosphonooxy-propan-2-yl] octadec-9-enoate" # loop_ _pdbx_chem_comp_audit.comp_id _pdbx_chem_comp_audit.action_type _pdbx_chem_comp_audit.date _pdbx_chem_comp_audit.processing_site D21 "Create component" 2017-10-16 RCSB D21 "Modify value order" 2017-10-18 RCSB D21 "Initial release" 2017-11-01 RCSB #