data_BIJ # _chem_comp.id BIJ _chem_comp.name "7-{[(2Z,5S)-5-CHLORO-2-{[2-METHOXY-4-(4-METHYLPIPERAZIN-1-YL)PHENYL]IMINO}-2,5-DIHYDROPYRIMIDIN-4-YL]AMINO}-2-METHYL-2,3-DIHYDRO-1H-ISOINDOL-1-ONE" _chem_comp.type non-polymer _chem_comp.pdbx_type ? _chem_comp.formula "C25 H28 Cl N7 O2" _chem_comp.mon_nstd_parent_comp_id ? _chem_comp.pdbx_synonyms ? _chem_comp.pdbx_formal_charge 0 _chem_comp.pdbx_initial_date 2008-08-28 _chem_comp.pdbx_modified_date 2011-06-04 _chem_comp.pdbx_ambiguous_flag ? _chem_comp.pdbx_release_status REL _chem_comp.pdbx_replaced_by ? _chem_comp.pdbx_replaces ? _chem_comp.formula_weight 493.989 _chem_comp.one_letter_code ? _chem_comp.three_letter_code BIJ _chem_comp.pdbx_model_coordinates_details ? _chem_comp.pdbx_model_coordinates_missing_flag N _chem_comp.pdbx_ideal_coordinates_details Corina _chem_comp.pdbx_ideal_coordinates_missing_flag N _chem_comp.pdbx_model_coordinates_db_code 2JKO _chem_comp.pdbx_subcomponent_list ? _chem_comp.pdbx_processing_site EBI # loop_ _chem_comp_atom.comp_id _chem_comp_atom.atom_id _chem_comp_atom.alt_atom_id _chem_comp_atom.type_symbol _chem_comp_atom.charge _chem_comp_atom.pdbx_align _chem_comp_atom.pdbx_aromatic_flag _chem_comp_atom.pdbx_leaving_atom_flag _chem_comp_atom.pdbx_stereo_config _chem_comp_atom.model_Cartn_x _chem_comp_atom.model_Cartn_y _chem_comp_atom.model_Cartn_z _chem_comp_atom.pdbx_model_Cartn_x_ideal _chem_comp_atom.pdbx_model_Cartn_y_ideal _chem_comp_atom.pdbx_model_Cartn_z_ideal _chem_comp_atom.pdbx_component_atom_id _chem_comp_atom.pdbx_component_comp_id _chem_comp_atom.pdbx_ordinal BIJ CBD CBD C 0 1 N N N 29.145 20.043 31.185 29.145 20.043 31.185 CBD BIJ 1 BIJ CBF CBF C 0 1 N N N 28.156 19.758 30.044 28.156 19.758 30.044 CBF BIJ 2 BIJ NBH NBH N 0 1 N N N 26.913 19.192 30.596 26.913 19.192 30.596 NBH BIJ 3 BIJ CBI CBI C 0 1 N N N 26.057 18.696 29.502 26.057 18.696 29.502 CBI BIJ 4 BIJ CBG CBG C 0 1 N N N 26.188 20.227 31.364 26.188 20.227 31.364 CBG BIJ 5 BIJ CBE CBE C 0 1 N N N 27.014 20.649 32.607 27.014 20.649 32.607 CBE BIJ 6 BIJ NBC NBC N 0 1 N N N 28.498 20.739 32.351 28.498 20.739 32.351 NBC BIJ 7 BIJ CBA CBA C 0 1 Y N N 29.325 21.475 33.252 29.325 21.475 33.252 CBA BIJ 8 BIJ CAW CAW C 0 1 Y N N 30.702 21.563 33.032 30.702 21.563 33.032 CAW BIJ 9 BIJ CAQ CAQ C 0 1 Y N N 31.539 22.275 33.902 31.539 22.275 33.902 CAQ BIJ 10 BIJ OAR OAR O 0 1 N N N 32.887 22.362 33.674 32.887 22.362 33.674 OAR BIJ 11 BIJ CAS CAS C 0 1 N N N 33.307 21.874 32.369 33.307 21.874 32.369 CAS BIJ 12 BIJ CAV CAV C 0 1 Y N N 28.792 22.110 34.381 28.792 22.110 34.381 CAV BIJ 13 BIJ CAP CAP C 0 1 Y N N 29.619 22.820 35.258 29.619 22.820 35.258 CAP BIJ 14 BIJ CAL CAL C 0 1 Y N N 30.997 22.918 35.022 30.997 22.918 35.022 CAL BIJ 15 BIJ NAH NAH N 0 1 N N N 31.826 23.586 35.848 31.826 23.586 35.848 NAH BIJ 16 BIJ C2 C2 C 0 1 N N N 31.548 24.703 36.547 31.548 24.703 36.547 C2 BIJ 17 BIJ N3 N3 N 0 1 N N N 30.289 25.183 36.629 30.289 25.183 36.629 N3 BIJ 18 BIJ N1 N1 N 0 1 N N N 32.556 25.340 37.183 32.556 25.340 37.183 N1 BIJ 19 BIJ C6 C6 C 0 1 N N N 32.330 26.442 37.892 32.330 26.442 37.892 C6 BIJ 20 BIJ C5 C5 C 0 1 N N S 31.034 26.959 37.986 31.034 26.959 37.986 C5 BIJ 21 BIJ CL5 CL5 CL 0 0 N N N 30.717 28.393 38.910 30.717 28.393 38.910 CL5 BIJ 22 BIJ C4 C4 C 0 1 N N N 29.993 26.294 37.334 29.993 26.294 37.334 C4 BIJ 23 BIJ NAE NAE N 0 1 N N N 28.727 26.760 37.407 28.727 26.760 37.407 NAE BIJ 24 BIJ CAJ CAJ C 0 1 Y N N 27.642 25.966 37.325 27.642 25.966 37.325 CAJ BIJ 25 BIJ CAN CAN C 0 1 Y N N 26.808 25.741 38.439 26.808 25.741 38.439 CAN BIJ 26 BIJ CAM CAM C 0 1 N N N 26.842 26.185 39.773 26.842 26.185 39.773 CAM BIJ 27 BIJ OAI OAI O 0 1 N N N 27.700 26.942 40.235 27.700 26.942 40.235 OAI BIJ 28 BIJ NAU NAU N 0 1 N N N 25.827 25.681 40.492 25.827 25.681 40.492 NAU BIJ 29 BIJ CAT CAT C 0 1 N N N 25.558 25.942 41.930 25.558 25.942 41.930 CAT BIJ 30 BIJ CAX CAX C 0 1 N N N 24.979 24.830 39.649 24.979 24.830 39.649 CAX BIJ 31 BIJ CAY CAY C 0 1 Y N N 25.689 24.905 38.297 25.689 24.905 38.297 CAY BIJ 32 BIJ CBB CBB C 0 1 Y N N 25.396 24.306 37.071 25.396 24.306 37.071 CBB BIJ 33 BIJ CAZ CAZ C 0 1 Y N N 26.218 24.533 35.968 26.218 24.533 35.968 CAZ BIJ 34 BIJ CAO CAO C 0 1 Y N N 27.331 25.364 36.098 27.331 25.364 36.098 CAO BIJ 35 BIJ HBD1 HBD1 H 0 0 N N N 29.556 19.085 31.536 29.556 19.085 31.536 HBD1 BIJ 36 BIJ HBD2 HBD2 H 0 0 N N N 29.928 20.707 30.791 29.928 20.707 30.791 HBD2 BIJ 37 BIJ HBF1 HBF1 H 0 0 N N N 27.928 20.695 29.515 27.928 20.695 29.515 HBF1 BIJ 38 BIJ HBF2 HBF2 H 0 0 N N N 28.605 19.039 29.343 28.605 19.039 29.343 HBF2 BIJ 39 BIJ HBI1 HBI1 H 0 0 N N N 25.027 18.573 29.869 25.027 18.573 29.869 HBI1 BIJ 40 BIJ HBI2 HBI2 H 0 0 N N N 26.067 19.419 28.673 26.067 19.419 28.673 HBI2 BIJ 41 BIJ HBI3 HBI3 H 0 0 N N N 26.439 17.727 29.149 26.439 17.727 29.149 HBI3 BIJ 42 BIJ HBG1 HBG1 H 0 0 N N N 26.024 21.106 30.723 26.024 21.106 30.723 HBG1 BIJ 43 BIJ HBG2 HBG2 H 0 0 N N N 25.223 19.817 31.696 25.223 19.817 31.696 HBG2 BIJ 44 BIJ HBE1 HBE1 H 0 0 N N N 26.663 21.641 32.929 26.663 21.641 32.929 HBE1 BIJ 45 BIJ HBE2 HBE2 H 0 0 N N N 26.865 19.873 33.372 26.865 19.872 33.372 HBE2 BIJ 46 BIJ HAW HAW H 0 1 N N N 31.131 21.071 32.172 31.131 21.071 32.172 HAW BIJ 47 BIJ HAV HAV H 0 1 N N N 27.731 22.051 34.577 27.732 22.051 34.576 HAV BIJ 48 BIJ HAS1 HAS1 H 0 0 N N N 33.413 22.722 31.677 33.413 22.722 31.677 HAS1 BIJ 49 BIJ HAS2 HAS2 H 0 0 N N N 34.273 21.356 32.465 34.273 21.356 32.465 HAS2 BIJ 50 BIJ HAS3 HAS3 H 0 0 N N N 32.553 21.175 31.979 32.553 21.175 31.979 HAS3 BIJ 51 BIJ HAP HAP H 0 1 N N N 29.191 23.298 36.127 29.191 23.298 36.127 HAP BIJ 52 BIJ H6 H6 H 0 1 N N N 33.147 26.938 38.395 33.147 26.938 38.395 H6 BIJ 53 BIJ H5 H5 H 0 1 N N N 31.105 28.054 38.069 31.105 28.053 38.069 H5 BIJ 54 BIJ HX2 HX2 H 0 1 N N N 23.929 25.156 39.612 23.929 25.156 39.612 HX2 BIJ 55 BIJ HAE HAE H 0 1 N N N 28.589 27.743 37.528 28.589 27.743 37.528 HAE BIJ 56 BIJ HAO HAO H 0 1 N N N 27.962 25.546 35.241 27.962 25.546 35.241 HAO BIJ 57 BIJ HAT1 HAT1 H 0 0 N N N 26.511 26.006 42.476 26.511 26.007 42.476 HAT1 BIJ 58 BIJ HAT2 HAT2 H 0 0 N N N 25.011 26.891 42.034 25.011 26.891 42.034 HAT2 BIJ 59 BIJ HAT3 HAT3 H 0 0 N N N 24.953 25.122 42.344 24.953 25.122 42.344 HAT3 BIJ 60 BIJ HAX HAX H 0 1 N N N 24.924 23.799 40.028 24.924 23.799 40.028 HAX BIJ 61 BIJ HBB HBB H 0 1 N N N 24.531 23.666 36.977 24.531 23.666 36.977 HBB BIJ 62 BIJ HAZ HAZ H 0 1 N N N 25.995 24.068 35.019 25.994 24.069 35.019 HAZ BIJ 63 # loop_ _chem_comp_bond.comp_id _chem_comp_bond.atom_id_1 _chem_comp_bond.atom_id_2 _chem_comp_bond.value_order _chem_comp_bond.pdbx_aromatic_flag _chem_comp_bond.pdbx_stereo_config _chem_comp_bond.pdbx_ordinal BIJ CBD CBF SING N N 1 BIJ CBD NBC SING N N 2 BIJ CBF NBH SING N N 3 BIJ NBH CBI SING N N 4 BIJ NBH CBG SING N N 5 BIJ CBG CBE SING N N 6 BIJ CBE NBC SING N N 7 BIJ NBC CBA SING N N 8 BIJ CBA CAW SING Y N 9 BIJ CBA CAV DOUB Y N 10 BIJ CAW CAQ DOUB Y N 11 BIJ CAQ OAR SING N N 12 BIJ CAQ CAL SING Y N 13 BIJ OAR CAS SING N N 14 BIJ CAV CAP SING Y N 15 BIJ CAP CAL DOUB Y N 16 BIJ CAL NAH SING N N 17 BIJ NAH C2 DOUB N N 18 BIJ C2 N3 SING N N 19 BIJ C2 N1 SING N N 20 BIJ N3 C4 DOUB N N 21 BIJ N1 C6 DOUB N N 22 BIJ C6 C5 SING N N 23 BIJ C5 CL5 SING N N 24 BIJ C5 C4 SING N N 25 BIJ C4 NAE SING N N 26 BIJ NAE CAJ SING N N 27 BIJ CAJ CAN SING Y N 28 BIJ CAJ CAO DOUB Y N 29 BIJ CAN CAM SING N N 30 BIJ CAN CAY DOUB Y N 31 BIJ CAM OAI DOUB N N 32 BIJ CAM NAU SING N N 33 BIJ NAU CAT SING N N 34 BIJ NAU CAX SING N N 35 BIJ CAX CAY SING N N 36 BIJ CAY CBB SING Y N 37 BIJ CBB CAZ DOUB Y N 38 BIJ CAZ CAO SING Y N 39 BIJ CBD HBD1 SING N N 40 BIJ CBD HBD2 SING N N 41 BIJ CBF HBF1 SING N N 42 BIJ CBF HBF2 SING N N 43 BIJ CBI HBI1 SING N N 44 BIJ CBI HBI2 SING N N 45 BIJ CBI HBI3 SING N N 46 BIJ CBG HBG1 SING N N 47 BIJ CBG HBG2 SING N N 48 BIJ CBE HBE1 SING N N 49 BIJ CBE HBE2 SING N N 50 BIJ CAW HAW SING N N 51 BIJ CAV HAV SING N N 52 BIJ CAS HAS1 SING N N 53 BIJ CAS HAS2 SING N N 54 BIJ CAS HAS3 SING N N 55 BIJ CAP HAP SING N N 56 BIJ C6 H6 SING N N 57 BIJ C5 H5 SING N N 58 BIJ NAE HAE SING N N 59 BIJ CAO HAO SING N N 60 BIJ CAT HAT1 SING N N 61 BIJ CAT HAT2 SING N N 62 BIJ CAT HAT3 SING N N 63 BIJ CAX HAX SING N N 64 BIJ CAX HX2 SING N N 65 BIJ CBB HBB SING N N 66 BIJ CAZ HAZ SING N N 67 # loop_ _pdbx_chem_comp_descriptor.comp_id _pdbx_chem_comp_descriptor.type _pdbx_chem_comp_descriptor.program _pdbx_chem_comp_descriptor.program_version _pdbx_chem_comp_descriptor.descriptor BIJ SMILES ACDLabs 10.04 "O=C2N(C)Cc1cccc(c12)NC3=NC(\N=CC3Cl)=N/c4ccc(cc4OC)N5CCN(C)CC5" BIJ SMILES_CANONICAL CACTVS 3.341 "COc1cc(ccc1N=C2N=C[C@H](Cl)C(=N2)Nc3cccc4CN(C)C(=O)c34)N5CCN(C)CC5" BIJ SMILES CACTVS 3.341 "COc1cc(ccc1N=C2N=C[CH](Cl)C(=N2)Nc3cccc4CN(C)C(=O)c34)N5CCN(C)CC5" BIJ SMILES_CANONICAL "OpenEye OEToolkits" 1.5.0 "CN1CCN(CC1)c2ccc(c(c2)OC)/N=C\3/N=CC(C(=N3)Nc4cccc5c4C(=O)N(C5)C)Cl" BIJ SMILES "OpenEye OEToolkits" 1.5.0 "CN1CCN(CC1)c2ccc(c(c2)OC)N=C3N=CC(C(=N3)Nc4cccc5c4C(=O)N(C5)C)Cl" BIJ InChI InChI 1.03 "InChI=1S/C25H28ClN7O2/c1-31-9-11-33(12-10-31)17-7-8-19(21(13-17)35-3)29-25-27-14-18(26)23(30-25)28-20-6-4-5-16-15-32(2)24(34)22(16)20/h4-8,13-14,18H,9-12,15H2,1-3H3,(H,28,29,30)/t18-/m0/s1" BIJ InChIKey InChI 1.03 YKRBTLCKGPASPO-SFHVURJKSA-N # loop_ _pdbx_chem_comp_identifier.comp_id _pdbx_chem_comp_identifier.type _pdbx_chem_comp_identifier.program _pdbx_chem_comp_identifier.program_version _pdbx_chem_comp_identifier.identifier BIJ "SYSTEMATIC NAME" ACDLabs 10.04 "7-{[(2Z,5S)-5-chloro-2-{[2-methoxy-4-(4-methylpiperazin-1-yl)phenyl]imino}-2,5-dihydropyrimidin-4-yl]amino}-2-methyl-2,3-dihydro-1H-isoindol-1-one" BIJ "SYSTEMATIC NAME" "OpenEye OEToolkits" 1.5.0 "7-[[(2Z)-5-chloro-2-[2-methoxy-4-(4-methylpiperazin-1-yl)phenyl]imino-5H-pyrimidin-4-yl]amino]-2-methyl-3H-isoindol-1-one" # loop_ _pdbx_chem_comp_audit.comp_id _pdbx_chem_comp_audit.action_type _pdbx_chem_comp_audit.date _pdbx_chem_comp_audit.processing_site BIJ "Create component" 2008-08-28 EBI BIJ "Modify aromatic_flag" 2011-06-04 RCSB BIJ "Modify descriptor" 2011-06-04 RCSB #