data_AYT # _chem_comp.id AYT _chem_comp.name "(1~{S},3~{Z})-3-[(2~{E})-2-[(1~{S},3~{a}~{S},7~{a}~{S})-7~{a}-methyl-1-[(2~{S})-6-methyl-2-oxidanyl-heptan-2-yl]-2,3,3~{a},5,6,7-hexahydro-1~{H}-inden-4-ylidene]ethylidene]-4-methylidene-cyclohexan-1-ol" _chem_comp.type NON-POLYMER _chem_comp.pdbx_type HETAIN _chem_comp.formula "C27 H44 O2" _chem_comp.mon_nstd_parent_comp_id ? _chem_comp.pdbx_synonyms ? _chem_comp.pdbx_formal_charge 0 _chem_comp.pdbx_initial_date 2017-08-31 _chem_comp.pdbx_modified_date 2018-02-02 _chem_comp.pdbx_ambiguous_flag N _chem_comp.pdbx_release_status REL _chem_comp.pdbx_replaced_by ? _chem_comp.pdbx_replaces ? _chem_comp.formula_weight 400.637 _chem_comp.one_letter_code ? _chem_comp.three_letter_code AYT _chem_comp.pdbx_model_coordinates_details ? _chem_comp.pdbx_model_coordinates_missing_flag N _chem_comp.pdbx_ideal_coordinates_details Corina _chem_comp.pdbx_ideal_coordinates_missing_flag N _chem_comp.pdbx_model_coordinates_db_code 5OW9 _chem_comp.pdbx_subcomponent_list ? _chem_comp.pdbx_processing_site EBI # loop_ _chem_comp_atom.comp_id _chem_comp_atom.atom_id _chem_comp_atom.alt_atom_id _chem_comp_atom.type_symbol _chem_comp_atom.charge _chem_comp_atom.pdbx_align _chem_comp_atom.pdbx_aromatic_flag _chem_comp_atom.pdbx_leaving_atom_flag _chem_comp_atom.pdbx_stereo_config _chem_comp_atom.model_Cartn_x _chem_comp_atom.model_Cartn_y _chem_comp_atom.model_Cartn_z _chem_comp_atom.pdbx_model_Cartn_x_ideal _chem_comp_atom.pdbx_model_Cartn_y_ideal _chem_comp_atom.pdbx_model_Cartn_z_ideal _chem_comp_atom.pdbx_component_atom_id _chem_comp_atom.pdbx_component_comp_id _chem_comp_atom.pdbx_ordinal AYT C4 C1 C 0 1 N N N -35.408 19.706 -5.460 4.743 0.146 -0.153 C4 AYT 1 AYT C5 C2 C 0 1 N N N -36.896 19.581 -5.697 6.086 0.075 0.547 C5 AYT 2 AYT C6 C3 C 0 1 N N S -37.685 20.741 -5.109 6.372 1.439 1.182 C6 AYT 3 AYT C7 C4 C 0 1 N N N -34.682 18.571 -5.229 3.815 -0.821 -0.001 C7 AYT 4 AYT C8 C5 C 0 1 N N N -33.713 21.241 -6.409 3.922 1.220 -2.202 C8 AYT 5 AYT C10 C6 C 0 1 N N N -33.300 18.479 -4.956 2.529 -0.716 -0.695 C10 AYT 6 AYT C11 C7 C 0 1 N N N -32.547 17.374 -4.853 1.611 -1.671 -0.545 C11 AYT 7 AYT C12 C8 C 0 1 N N S -31.076 17.437 -4.496 0.278 -1.619 -1.229 C12 AYT 8 AYT C13 C9 C 0 1 N N S -30.214 17.082 -5.748 -0.778 -1.669 -0.088 C13 AYT 9 AYT C14 C10 C 0 1 N N N -30.595 15.649 -6.181 -0.682 -3.028 0.564 C14 AYT 10 AYT C15 C11 C 0 1 N N N -32.100 15.453 -6.413 0.671 -3.099 1.292 C15 AYT 11 AYT C1 C12 C 0 1 N N N -37.126 22.061 -5.603 6.351 2.526 0.106 C1 AYT 12 AYT C2 C13 C 0 1 N N N -35.654 22.206 -5.223 4.934 2.670 -0.458 C2 AYT 13 AYT C3 C14 C 0 1 N N N -34.834 21.047 -5.721 4.499 1.329 -1.005 C3 AYT 14 AYT O9 O1 O 0 1 N N N -37.660 20.695 -3.680 7.658 1.413 1.805 O9 AYT 15 AYT C16 C15 C 0 1 N N N -32.952 15.976 -5.246 1.845 -2.896 0.328 C16 AYT 16 AYT C17 C16 C 0 1 N N S -28.801 17.240 -5.079 -2.072 -1.297 -0.795 C17 AYT 17 AYT C18 C17 C 0 1 N N N -28.905 18.584 -4.320 -1.644 -0.354 -1.949 C18 AYT 18 AYT C19 C18 C 0 1 N N N -30.393 18.699 -3.919 -0.090 -0.303 -1.918 C19 AYT 19 AYT C20 C19 C 0 1 N N S -27.458 17.075 -5.895 -3.013 -0.568 0.166 C20 AYT 20 AYT C21 C20 C 0 1 N N N -27.194 18.049 -7.054 -4.307 -0.204 -0.565 C21 AYT 21 AYT C22 C21 C 0 1 N N N -26.236 17.063 -4.987 -3.336 -1.478 1.352 C22 AYT 22 AYT C23 C22 C 0 1 N N N -26.900 17.427 -8.418 -5.247 0.526 0.397 C23 AYT 23 AYT O24 O2 O 0 1 N N N -27.472 15.779 -6.519 -2.381 0.624 0.638 O24 AYT 24 AYT C25 C23 C 0 1 N N N -25.817 18.146 -9.210 -6.541 0.890 -0.334 C25 AYT 25 AYT C26 C24 C 0 1 N N N -25.442 17.552 -10.577 -7.482 1.619 0.627 C26 AYT 26 AYT C27 C25 C 0 1 N N N -26.578 17.572 -11.599 -6.858 2.955 1.036 C27 AYT 27 AYT C28 C26 C 0 1 N N N -24.213 18.231 -11.147 -8.822 1.873 -0.065 C28 AYT 28 AYT C29 C27 C 0 1 N N N -30.468 18.068 -6.914 -0.445 -0.597 0.952 C29 AYT 29 AYT H1 H1 H 0 1 N N N -37.078 19.546 -6.781 6.056 -0.692 1.322 H1 AYT 30 AYT H2 H2 H 0 1 N N N -37.248 18.647 -5.236 6.865 -0.164 -0.177 H2 AYT 31 AYT H3 H3 H 0 1 N N N -38.725 20.658 -5.457 5.611 1.658 1.931 H3 AYT 32 AYT H4 H4 H 0 1 N N N -35.227 17.639 -5.259 4.019 -1.672 0.632 H4 AYT 33 AYT H5 H5 H 0 1 N N N -33.376 22.245 -6.620 3.622 0.250 -2.570 H5 AYT 34 AYT H6 H6 H 0 1 N N N -33.140 20.395 -6.757 3.756 2.102 -2.803 H6 AYT 35 AYT H7 H7 H 0 1 N N N -32.784 19.417 -4.812 2.324 0.135 -1.327 H7 AYT 36 AYT H8 H8 H 0 1 N N N -30.897 16.633 -3.767 0.163 -2.459 -1.914 H8 AYT 37 AYT H9 H9 H 0 1 N N N -30.271 14.951 -5.395 -1.494 -3.153 1.280 H9 AYT 38 AYT H10 H10 H 0 1 N N N -30.066 15.417 -7.117 -0.735 -3.808 -0.196 H10 AYT 39 AYT H11 H11 H 0 1 N N N -32.388 15.991 -7.328 0.702 -2.326 2.061 H11 AYT 40 AYT H12 H12 H 0 1 N N N -32.300 14.379 -6.541 0.768 -4.075 1.767 H12 AYT 41 AYT H13 H13 H 0 1 N N N -37.697 22.886 -5.152 6.666 3.475 0.540 H13 AYT 42 AYT H14 H14 H 0 1 N N N -37.221 22.105 -6.698 7.035 2.251 -0.697 H14 AYT 43 AYT H15 H15 H 0 1 N N N -35.572 22.256 -4.127 4.252 2.979 0.334 H15 AYT 44 AYT H16 H16 H 0 1 N N N -35.262 23.135 -5.663 4.930 3.412 -1.256 H16 AYT 45 AYT H17 H17 H 0 1 N N N -38.157 21.425 -3.330 7.743 0.750 2.503 H17 AYT 46 AYT H18 H18 H 0 1 N N N -34.009 15.982 -5.549 1.948 -3.780 -0.302 H18 AYT 47 AYT H19 H19 H 0 1 N N N -32.822 15.309 -4.381 2.761 -2.757 0.902 H19 AYT 48 AYT H20 H20 H 0 1 N N N -28.761 16.465 -4.300 -2.555 -2.189 -1.195 H20 AYT 49 AYT H21 H21 H 0 1 N N N -28.263 18.575 -3.427 -1.986 -0.752 -2.905 H21 AYT 50 AYT H22 H22 H 0 1 N N N -28.614 19.421 -4.972 -2.054 0.643 -1.790 H22 AYT 51 AYT H23 H23 H 0 1 N N N -30.838 19.608 -4.350 0.257 0.549 -1.334 H23 AYT 52 AYT H24 H24 H 0 1 N N N -30.495 18.725 -2.824 0.316 -0.270 -2.929 H24 AYT 53 AYT H25 H25 H 0 1 N N N -26.329 18.670 -6.777 -4.076 0.445 -1.410 H25 AYT 54 AYT H26 H26 H 0 1 N N N -28.084 18.687 -7.163 -4.788 -1.112 -0.925 H26 AYT 55 AYT H27 H27 H 0 1 N N N -26.407 16.370 -4.150 -2.414 -1.738 1.873 H27 AYT 56 AYT H28 H28 H 0 1 N N N -25.356 16.735 -5.560 -4.006 -0.959 2.037 H28 AYT 57 AYT H29 H29 H 0 1 N N N -26.061 18.076 -4.594 -3.818 -2.387 0.992 H29 AYT 58 AYT H30 H30 H 0 1 N N N -27.827 17.440 -9.010 -5.477 -0.123 1.242 H30 AYT 59 AYT H31 H31 H 0 1 N N N -26.580 16.386 -8.261 -4.765 1.435 0.757 H31 AYT 60 AYT H32 H32 H 0 1 N N N -27.632 15.112 -5.861 -2.147 1.249 -0.062 H32 AYT 61 AYT H33 H33 H 0 1 N N N -24.907 18.158 -8.592 -6.311 1.539 -1.179 H33 AYT 62 AYT H34 H34 H 0 1 N N N -26.159 19.178 -9.379 -7.023 -0.019 -0.694 H34 AYT 63 AYT H35 H35 H 0 1 N N N -25.181 16.497 -10.407 -7.641 1.007 1.515 H35 AYT 64 AYT H36 H36 H 0 1 N N N -27.463 17.077 -11.174 -6.698 3.568 0.149 H36 AYT 65 AYT H37 H37 H 0 1 N N N -26.826 18.614 -11.851 -7.528 3.475 1.721 H37 AYT 66 AYT H38 H38 H 0 1 N N N -26.262 17.040 -12.509 -5.903 2.775 1.529 H38 AYT 67 AYT H39 H39 H 0 1 N N N -23.403 18.210 -10.403 -9.267 0.921 -0.356 H39 AYT 68 AYT H40 H40 H 0 1 N N N -23.890 17.701 -12.055 -9.492 2.393 0.620 H40 AYT 69 AYT H41 H41 H 0 1 N N N -24.454 19.275 -11.397 -8.663 2.486 -0.952 H41 AYT 70 AYT H42 H42 H 0 1 N N N -30.195 19.086 -6.600 -1.195 -0.614 1.744 H42 AYT 71 AYT H43 H43 H 0 1 N N N -29.857 17.776 -7.781 0.538 -0.798 1.379 H43 AYT 72 AYT H44 H44 H 0 1 N N N -31.532 18.043 -7.190 -0.442 0.383 0.476 H44 AYT 73 # loop_ _chem_comp_bond.comp_id _chem_comp_bond.atom_id_1 _chem_comp_bond.atom_id_2 _chem_comp_bond.value_order _chem_comp_bond.pdbx_aromatic_flag _chem_comp_bond.pdbx_stereo_config _chem_comp_bond.pdbx_ordinal AYT C27 C26 SING N N 1 AYT C28 C26 SING N N 2 AYT C26 C25 SING N N 3 AYT C25 C23 SING N N 4 AYT C23 C21 SING N N 5 AYT C21 C20 SING N N 6 AYT C29 C13 SING N N 7 AYT O24 C20 SING N N 8 AYT C15 C14 SING N N 9 AYT C15 C16 SING N N 10 AYT C8 C3 DOUB N N 11 AYT C14 C13 SING N N 12 AYT C20 C17 SING N N 13 AYT C20 C22 SING N N 14 AYT C13 C17 SING N N 15 AYT C13 C12 SING N N 16 AYT C3 C4 SING N N 17 AYT C3 C2 SING N N 18 AYT C5 C4 SING N N 19 AYT C5 C6 SING N N 20 AYT C1 C2 SING N N 21 AYT C1 C6 SING N N 22 AYT C4 C7 DOUB N Z 23 AYT C16 C11 SING N N 24 AYT C7 C10 SING N N 25 AYT C6 O9 SING N N 26 AYT C17 C18 SING N N 27 AYT C10 C11 DOUB N E 28 AYT C11 C12 SING N N 29 AYT C12 C19 SING N N 30 AYT C18 C19 SING N N 31 AYT C5 H1 SING N N 32 AYT C5 H2 SING N N 33 AYT C6 H3 SING N N 34 AYT C7 H4 SING N N 35 AYT C8 H5 SING N N 36 AYT C8 H6 SING N N 37 AYT C10 H7 SING N N 38 AYT C12 H8 SING N N 39 AYT C14 H9 SING N N 40 AYT C14 H10 SING N N 41 AYT C15 H11 SING N N 42 AYT C15 H12 SING N N 43 AYT C1 H13 SING N N 44 AYT C1 H14 SING N N 45 AYT C2 H15 SING N N 46 AYT C2 H16 SING N N 47 AYT O9 H17 SING N N 48 AYT C16 H18 SING N N 49 AYT C16 H19 SING N N 50 AYT C17 H20 SING N N 51 AYT C18 H21 SING N N 52 AYT C18 H22 SING N N 53 AYT C19 H23 SING N N 54 AYT C19 H24 SING N N 55 AYT C21 H25 SING N N 56 AYT C21 H26 SING N N 57 AYT C22 H27 SING N N 58 AYT C22 H28 SING N N 59 AYT C22 H29 SING N N 60 AYT C23 H30 SING N N 61 AYT C23 H31 SING N N 62 AYT O24 H32 SING N N 63 AYT C25 H33 SING N N 64 AYT C25 H34 SING N N 65 AYT C26 H35 SING N N 66 AYT C27 H36 SING N N 67 AYT C27 H37 SING N N 68 AYT C27 H38 SING N N 69 AYT C28 H39 SING N N 70 AYT C28 H40 SING N N 71 AYT C28 H41 SING N N 72 AYT C29 H42 SING N N 73 AYT C29 H43 SING N N 74 AYT C29 H44 SING N N 75 # loop_ _pdbx_chem_comp_descriptor.comp_id _pdbx_chem_comp_descriptor.type _pdbx_chem_comp_descriptor.program _pdbx_chem_comp_descriptor.program_version _pdbx_chem_comp_descriptor.descriptor AYT InChI InChI 1.03 "InChI=1S/C27H44O2/c1-19(2)8-6-17-27(5,29)25-15-14-24-21(9-7-16-26(24,25)4)11-12-22-18-23(28)13-10-20(22)3/h11-12,19,23-25,28-29H,3,6-10,13-18H2,1-2,4-5H3/b21-11+,22-12-/t23-,24-,25-,26-,27-/m0/s1" AYT InChIKey InChI 1.03 IQEQEOBGZMEDBQ-LBRHRNEPSA-N AYT SMILES_CANONICAL CACTVS 3.385 "CC(C)CCC[C@](C)(O)[C@H]1CC[C@H]2/C(CCC[C@]12C)=C/C=C3/C[C@@H](O)CCC3=C" AYT SMILES CACTVS 3.385 "CC(C)CCC[C](C)(O)[CH]1CC[CH]2C(CCC[C]12C)=CC=C3C[CH](O)CCC3=C" AYT SMILES_CANONICAL "OpenEye OEToolkits" 2.0.6 "CC(C)CCC[C@@](C)([C@H]1CC[C@@H]\2[C@@]1(CCC/C2=C\C=C/3\C[C@H](CCC3=C)O)C)O" AYT SMILES "OpenEye OEToolkits" 2.0.6 "CC(C)CCCC(C)(C1CCC2C1(CCCC2=CC=C3CC(CCC3=C)O)C)O" # loop_ _pdbx_chem_comp_identifier.comp_id _pdbx_chem_comp_identifier.type _pdbx_chem_comp_identifier.program _pdbx_chem_comp_identifier.program_version _pdbx_chem_comp_identifier.identifier AYT "SYSTEMATIC NAME" "OpenEye OEToolkits" 2.0.6 "(1~{S},3~{Z})-3-[(2~{E})-2-[(1~{S},3~{a}~{S},7~{a}~{S})-7~{a}-methyl-1-[(2~{S})-6-methyl-2-oxidanyl-heptan-2-yl]-2,3,3~{a},5,6,7-hexahydro-1~{H}-inden-4-ylidene]ethylidene]-4-methylidene-cyclohexan-1-ol" # loop_ _pdbx_chem_comp_audit.comp_id _pdbx_chem_comp_audit.action_type _pdbx_chem_comp_audit.date _pdbx_chem_comp_audit.processing_site AYT "Create component" 2017-08-31 EBI AYT "Initial release" 2018-02-07 RCSB #