data_6GM # _chem_comp.id 6GM _chem_comp.name "4-(2-amino-6-{bis[(pyridin-2-yl)methyl]amino}pyrimidin-4-yl)phenol" _chem_comp.type NON-POLYMER _chem_comp.pdbx_type HETAIN _chem_comp.formula "C22 H20 N6 O" _chem_comp.mon_nstd_parent_comp_id ? _chem_comp.pdbx_synonyms ? _chem_comp.pdbx_formal_charge 0 _chem_comp.pdbx_initial_date 2016-04-06 _chem_comp.pdbx_modified_date 2017-03-03 _chem_comp.pdbx_ambiguous_flag N _chem_comp.pdbx_release_status REL _chem_comp.pdbx_replaced_by ? _chem_comp.pdbx_replaces ? _chem_comp.formula_weight 384.434 _chem_comp.one_letter_code ? _chem_comp.three_letter_code 6GM _chem_comp.pdbx_model_coordinates_details ? _chem_comp.pdbx_model_coordinates_missing_flag N _chem_comp.pdbx_ideal_coordinates_details Corina _chem_comp.pdbx_ideal_coordinates_missing_flag N _chem_comp.pdbx_model_coordinates_db_code 5J5I _chem_comp.pdbx_subcomponent_list ? _chem_comp.pdbx_processing_site RCSB # loop_ _chem_comp_atom.comp_id _chem_comp_atom.atom_id _chem_comp_atom.alt_atom_id _chem_comp_atom.type_symbol _chem_comp_atom.charge _chem_comp_atom.pdbx_align _chem_comp_atom.pdbx_aromatic_flag _chem_comp_atom.pdbx_leaving_atom_flag _chem_comp_atom.pdbx_stereo_config _chem_comp_atom.model_Cartn_x _chem_comp_atom.model_Cartn_y _chem_comp_atom.model_Cartn_z _chem_comp_atom.pdbx_model_Cartn_x_ideal _chem_comp_atom.pdbx_model_Cartn_y_ideal _chem_comp_atom.pdbx_model_Cartn_z_ideal _chem_comp_atom.pdbx_component_atom_id _chem_comp_atom.pdbx_component_comp_id _chem_comp_atom.pdbx_ordinal 6GM C10 C1 C 0 1 Y N N 182.742 -30.664 161.923 -3.606 0.991 -0.477 C10 6GM 1 6GM C13 C2 C 0 1 Y N N 183.294 -25.967 157.326 3.366 -1.948 0.479 C13 6GM 2 6GM C15 C3 C 0 1 Y N N 183.148 -23.828 158.419 5.020 -0.694 1.648 C15 6GM 3 6GM C17 C4 C 0 1 N N N 187.770 -27.493 158.044 1.164 1.029 -1.896 C17 6GM 4 6GM C20 C5 C 0 1 Y N N 190.015 -24.628 160.107 2.376 3.504 1.309 C20 6GM 5 6GM C21 C6 C 0 1 Y N N 190.641 -25.726 159.520 3.315 3.162 0.348 C21 6GM 6 6GM C22 C7 C 0 1 Y N N 189.882 -26.678 158.845 2.917 2.351 -0.704 C22 6GM 7 6GM C06 C8 C 0 1 Y N N 181.948 -28.624 160.895 -4.487 -0.978 0.605 C06 6GM 8 6GM C07 C9 C 0 1 Y N N 180.631 -28.998 161.171 -5.707 -0.351 0.747 C07 6GM 9 6GM C08 C10 C 0 1 Y N N 180.366 -30.209 161.818 -5.879 0.947 0.284 C08 6GM 10 6GM O01 O1 O 0 1 N N N 179.075 -30.584 162.088 -7.082 1.562 0.425 O01 6GM 11 6GM C09 C11 C 0 1 Y N N 181.427 -31.039 162.197 -4.828 1.613 -0.333 C09 6GM 12 6GM C05 C12 C 0 1 Y N N 183.010 -29.454 161.277 -3.428 -0.310 -0.008 C05 6GM 13 6GM C04 C13 C 0 1 Y N N 184.325 -29.090 160.990 -2.115 -0.982 -0.162 C04 6GM 14 6GM C03 C14 C 0 1 Y N N 184.614 -28.484 159.768 -1.050 -0.320 -0.769 C03 6GM 15 6GM N03 N1 N 0 1 Y N N 185.322 -29.336 161.864 -1.936 -2.226 0.282 N03 6GM 16 6GM C01 C15 C 0 1 Y N N 186.589 -28.995 161.576 -0.767 -2.832 0.148 C01 6GM 17 6GM N01 N2 N 0 1 N N N 187.583 -29.220 162.430 -0.620 -4.124 0.622 N01 6GM 18 6GM N02 N3 N 0 1 Y N N 186.875 -28.411 160.415 0.266 -2.235 -0.428 N02 6GM 19 6GM C02 C16 C 0 1 Y N N 185.935 -28.139 159.510 0.164 -0.992 -0.891 C02 6GM 20 6GM N04 N4 N 0 1 N N N 186.329 -27.571 158.372 1.252 -0.375 -1.488 N04 6GM 21 6GM C18 C17 C 0 1 Y N N 188.497 -26.522 158.748 1.607 1.912 -0.758 C18 6GM 22 6GM N06 N5 N 0 1 Y N N 187.890 -25.453 159.308 0.741 2.258 0.174 N06 6GM 23 6GM C19 C18 C 0 1 Y N N 188.629 -24.484 159.996 1.085 3.024 1.191 C19 6GM 24 6GM C11 C19 C 0 1 N N N 185.387 -27.173 157.295 2.490 -1.126 -1.711 C11 6GM 25 6GM C12 C20 C 0 1 Y N N 184.640 -26.058 157.674 3.388 -0.983 -0.509 C12 6GM 26 6GM N05 N6 N 0 1 Y N N 185.214 -25.069 158.367 4.185 0.064 -0.412 N05 6GM 27 6GM C16 C21 C 0 1 Y N N 184.494 -23.935 158.760 4.987 0.231 0.621 C16 6GM 28 6GM C14 C22 C 0 1 Y N N 182.545 -24.851 157.696 4.195 -1.806 1.582 C14 6GM 29 6GM H1 H1 H 0 1 N N N 183.557 -31.312 162.211 -2.789 1.510 -0.957 H1 6GM 30 6GM H2 H2 H 0 1 N N N 182.829 -26.765 156.767 2.707 -2.800 0.397 H2 6GM 31 6GM H3 H3 H 0 1 N N N 182.578 -22.959 158.713 5.679 -0.551 2.491 H3 6GM 32 6GM H4 H4 H 0 1 N N N 188.220 -28.474 158.257 1.809 1.198 -2.759 H4 6GM 33 6GM H5 H5 H 0 1 N N N 187.862 -27.273 156.970 0.134 1.267 -2.161 H5 6GM 34 6GM H6 H6 H 0 1 N N N 190.597 -23.893 160.644 2.651 4.135 2.141 H6 6GM 35 6GM H7 H7 H 0 1 N N N 191.713 -25.838 159.589 4.331 3.520 0.416 H7 6GM 36 6GM H8 H8 H 0 1 N N N 190.363 -27.535 158.397 3.622 2.064 -1.471 H8 6GM 37 6GM H9 H9 H 0 1 N N N 182.148 -27.693 160.386 -4.353 -1.988 0.965 H9 6GM 38 6GM H10 H10 H 0 1 N N N 179.816 -28.351 160.884 -6.527 -0.868 1.222 H10 6GM 39 6GM H11 H11 H 0 1 N N N 179.075 -31.426 162.527 -7.178 2.054 1.252 H11 6GM 40 6GM H12 H12 H 0 1 N N N 181.227 -31.972 162.703 -4.968 2.619 -0.700 H12 6GM 41 6GM H13 H13 H 0 1 N N N 183.836 -28.289 159.045 -1.163 0.690 -1.136 H13 6GM 42 6GM H14 H14 H 0 1 N N N 188.442 -28.893 162.036 -1.368 -4.573 1.046 H14 6GM 43 6GM H15 H15 H 0 1 N N N 187.403 -28.736 163.286 0.231 -4.580 0.531 H15 6GM 44 6GM H16 H16 H 0 1 N N N 188.133 -23.632 160.437 0.348 3.286 1.935 H16 6GM 45 6GM H17 H17 H 0 1 N N N 184.704 -28.010 157.086 2.253 -2.179 -1.863 H17 6GM 46 6GM H18 H18 H 0 1 N N N 185.959 -26.931 156.387 2.998 -0.736 -2.592 H18 6GM 47 6GM H19 H19 H 0 1 N N N 184.978 -23.150 159.322 5.626 1.101 0.665 H19 6GM 48 6GM H20 H20 H 0 1 N N N 181.502 -24.782 157.423 4.199 -2.545 2.369 H20 6GM 49 # loop_ _chem_comp_bond.comp_id _chem_comp_bond.atom_id_1 _chem_comp_bond.atom_id_2 _chem_comp_bond.value_order _chem_comp_bond.pdbx_aromatic_flag _chem_comp_bond.pdbx_stereo_config _chem_comp_bond.pdbx_ordinal 6GM C11 C12 SING N N 1 6GM C11 N04 SING N N 2 6GM C13 C12 DOUB Y N 3 6GM C13 C14 SING Y N 4 6GM C12 N05 SING Y N 5 6GM C14 C15 DOUB Y N 6 6GM C17 N04 SING N N 7 6GM C17 C18 SING N N 8 6GM N05 C16 DOUB Y N 9 6GM N04 C02 SING N N 10 6GM C15 C16 SING Y N 11 6GM C18 C22 DOUB Y N 12 6GM C18 N06 SING Y N 13 6GM C22 C21 SING Y N 14 6GM N06 C19 DOUB Y N 15 6GM C02 C03 DOUB Y N 16 6GM C02 N02 SING Y N 17 6GM C21 C20 DOUB Y N 18 6GM C03 C04 SING Y N 19 6GM C19 C20 SING Y N 20 6GM N02 C01 DOUB Y N 21 6GM C06 C07 DOUB Y N 22 6GM C06 C05 SING Y N 23 6GM C04 C05 SING N N 24 6GM C04 N03 DOUB Y N 25 6GM C07 C08 SING Y N 26 6GM C05 C10 DOUB Y N 27 6GM C01 N03 SING Y N 28 6GM C01 N01 SING N N 29 6GM C08 O01 SING N N 30 6GM C08 C09 DOUB Y N 31 6GM C10 C09 SING Y N 32 6GM C10 H1 SING N N 33 6GM C13 H2 SING N N 34 6GM C15 H3 SING N N 35 6GM C17 H4 SING N N 36 6GM C17 H5 SING N N 37 6GM C20 H6 SING N N 38 6GM C21 H7 SING N N 39 6GM C22 H8 SING N N 40 6GM C06 H9 SING N N 41 6GM C07 H10 SING N N 42 6GM O01 H11 SING N N 43 6GM C09 H12 SING N N 44 6GM C03 H13 SING N N 45 6GM N01 H14 SING N N 46 6GM N01 H15 SING N N 47 6GM C19 H16 SING N N 48 6GM C11 H17 SING N N 49 6GM C11 H18 SING N N 50 6GM C16 H19 SING N N 51 6GM C14 H20 SING N N 52 # loop_ _pdbx_chem_comp_descriptor.comp_id _pdbx_chem_comp_descriptor.type _pdbx_chem_comp_descriptor.program _pdbx_chem_comp_descriptor.program_version _pdbx_chem_comp_descriptor.descriptor 6GM SMILES ACDLabs 12.01 "c1cc(ccc1c2nc(N)nc(c2)N(Cc3ccccn3)Cc4ccccn4)O" 6GM InChI InChI 1.03 "InChI=1S/C22H20N6O/c23-22-26-20(16-7-9-19(29)10-8-16)13-21(27-22)28(14-17-5-1-3-11-24-17)15-18-6-2-4-12-25-18/h1-13,29H,14-15H2,(H2,23,26,27)" 6GM InChIKey InChI 1.03 LXSAXBJSZAHFFN-UHFFFAOYSA-N 6GM SMILES_CANONICAL CACTVS 3.385 "Nc1nc(cc(n1)c2ccc(O)cc2)N(Cc3ccccn3)Cc4ccccn4" 6GM SMILES CACTVS 3.385 "Nc1nc(cc(n1)c2ccc(O)cc2)N(Cc3ccccn3)Cc4ccccn4" 6GM SMILES_CANONICAL "OpenEye OEToolkits" 2.0.4 "c1ccnc(c1)CN(Cc2ccccn2)c3cc(nc(n3)N)c4ccc(cc4)O" 6GM SMILES "OpenEye OEToolkits" 2.0.4 "c1ccnc(c1)CN(Cc2ccccn2)c3cc(nc(n3)N)c4ccc(cc4)O" # loop_ _pdbx_chem_comp_identifier.comp_id _pdbx_chem_comp_identifier.type _pdbx_chem_comp_identifier.program _pdbx_chem_comp_identifier.program_version _pdbx_chem_comp_identifier.identifier 6GM "SYSTEMATIC NAME" ACDLabs 12.01 "4-(2-amino-6-{bis[(pyridin-2-yl)methyl]amino}pyrimidin-4-yl)phenol" 6GM "SYSTEMATIC NAME" "OpenEye OEToolkits" 2.0.4 "4-[2-azanyl-6-[bis(pyridin-2-ylmethyl)amino]pyrimidin-4-yl]phenol" # loop_ _pdbx_chem_comp_audit.comp_id _pdbx_chem_comp_audit.action_type _pdbx_chem_comp_audit.date _pdbx_chem_comp_audit.processing_site 6GM "Create component" 2016-04-06 RCSB 6GM "Initial release" 2017-03-08 RCSB #